Protein–RNA interactions for Protein: Q96PX6

CCDC85A, Coiled-coil domain-containing protein 85A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85AQ96PX6 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC85AQ96PX6 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC85AQ96PX6 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC85AQ96PX6 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC85AQ96PX6 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC85AQ96PX6 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC85AQ96PX6 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC85AQ96PX6 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC85AQ96PX6 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC85AQ96PX6 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC85AQ96PX6 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC85AQ96PX6 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC85AQ96PX6 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC85AQ96PX6 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC85AQ96PX6 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC85AQ96PX6 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC85AQ96PX6 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC85AQ96PX6 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC85AQ96PX6 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC85AQ96PX6 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC85AQ96PX6 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC85AQ96PX6 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC85AQ96PX6 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC85AQ96PX6 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC85AQ96PX6 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC85AQ96PX6 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC85AQ96PX6 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC85AQ96PX6 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC85AQ96PX6 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC85AQ96PX6 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC85AQ96PX6 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC85AQ96PX6 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC85AQ96PX6 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC85AQ96PX6 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC85AQ96PX6 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC85AQ96PX6 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC85AQ96PX6 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC85AQ96PX6 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC85AQ96PX6 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC85AQ96PX6 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC85AQ96PX6 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC85AQ96PX6 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC85AQ96PX6 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC85AQ96PX6 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC85AQ96PX6 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC85AQ96PX6 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC85AQ96PX6 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC85AQ96PX6 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC85AQ96PX6 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC85AQ96PX6 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC85AQ96PX6 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC85AQ96PX6 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC85AQ96PX6 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC85AQ96PX6 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC85AQ96PX6 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC85AQ96PX6 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC85AQ96PX6 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC85AQ96PX6 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC85AQ96PX6 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC85AQ96PX6 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC85AQ96PX6 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC85AQ96PX6 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC85AQ96PX6 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC85AQ96PX6 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC85AQ96PX6 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC85AQ96PX6 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC85AQ96PX6 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC85AQ96PX6 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC85AQ96PX6 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC85AQ96PX6 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC85AQ96PX6 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC85AQ96PX6 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC85AQ96PX6 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC85AQ96PX6 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC85AQ96PX6 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC85AQ96PX6 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC85AQ96PX6 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC85AQ96PX6 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC85AQ96PX6 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC85AQ96PX6 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC85AQ96PX6 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC85AQ96PX6 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC85AQ96PX6 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC85AQ96PX6 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC85AQ96PX6 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC85AQ96PX6 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC85AQ96PX6 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC85AQ96PX6 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC85AQ96PX6 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC85AQ96PX6 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC85AQ96PX6 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC85AQ96PX6 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC85AQ96PX6 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC85AQ96PX6 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC85AQ96PX6 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC85AQ96PX6 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC85AQ96PX6 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC85AQ96PX6 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC85AQ96PX6 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC85AQ96PX6 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms