Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
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C9orf135Q5VTT2 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
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C9orf135Q5VTT2 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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C9orf135Q5VTT2 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
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C9orf135Q5VTT2 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
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C9orf135Q5VTT2 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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C9orf135Q5VTT2 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C9orf135Q5VTT2 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
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