Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TUBA3CQ13748 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBA3CQ13748 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
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