Protein–RNA interactions for Protein: Q04118

PRB3, Basic salivary proline-rich protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRB3Q04118 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRB3Q04118 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PRB3Q04118 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PRB3Q04118 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PRB3Q04118 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PRB3Q04118 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PRB3Q04118 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRB3Q04118 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRB3Q04118 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRB3Q04118 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRB3Q04118 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRB3Q04118 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRB3Q04118 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRB3Q04118 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRB3Q04118 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRB3Q04118 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PRB3Q04118 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms