Protein–RNA interactions for Protein: Q00604

NDP, Norrin, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDPQ00604 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDPQ00604 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDPQ00604 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDPQ00604 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDPQ00604 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDPQ00604 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDPQ00604 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDPQ00604 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDPQ00604 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDPQ00604 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDPQ00604 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDPQ00604 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDPQ00604 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDPQ00604 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDPQ00604 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDPQ00604 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDPQ00604 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDPQ00604 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDPQ00604 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDPQ00604 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDPQ00604 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDPQ00604 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDPQ00604 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDPQ00604 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDPQ00604 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDPQ00604 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDPQ00604 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDPQ00604 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDPQ00604 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDPQ00604 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDPQ00604 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDPQ00604 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDPQ00604 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDPQ00604 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDPQ00604 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDPQ00604 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDPQ00604 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDPQ00604 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDPQ00604 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDPQ00604 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDPQ00604 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDPQ00604 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDPQ00604 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDPQ00604 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDPQ00604 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDPQ00604 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDPQ00604 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDPQ00604 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDPQ00604 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NDPQ00604 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NDPQ00604 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NDPQ00604 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NDPQ00604 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDPQ00604 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDPQ00604 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDPQ00604 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NDPQ00604 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDPQ00604 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDPQ00604 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDPQ00604 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDPQ00604 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDPQ00604 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDPQ00604 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDPQ00604 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDPQ00604 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDPQ00604 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NDPQ00604 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDPQ00604 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDPQ00604 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NDPQ00604 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDPQ00604 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDPQ00604 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDPQ00604 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDPQ00604 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NDPQ00604 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDPQ00604 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDPQ00604 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDPQ00604 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDPQ00604 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDPQ00604 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDPQ00604 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDPQ00604 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDPQ00604 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDPQ00604 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDPQ00604 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDPQ00604 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDPQ00604 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NDPQ00604 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDPQ00604 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NDPQ00604 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NDPQ00604 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NDPQ00604 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NDPQ00604 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDPQ00604 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDPQ00604 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDPQ00604 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NDPQ00604 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NDPQ00604 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDPQ00604 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDPQ00604 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms