Protein–RNA interactions for Protein: O95857

TSPAN13, Tetraspanin-13, humanhuman

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN13O95857 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TSPAN13O95857 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TSPAN13O95857 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TSPAN13O95857 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TSPAN13O95857 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TSPAN13O95857 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TSPAN13O95857 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
TSPAN13O95857 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TSPAN13O95857 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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TSPAN13O95857 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TSPAN13O95857 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TSPAN13O95857 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TSPAN13O95857 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TSPAN13O95857 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TSPAN13O95857 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TSPAN13O95857 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TSPAN13O95857 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TSPAN13O95857 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TSPAN13O95857 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TSPAN13O95857 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TSPAN13O95857 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TSPAN13O95857 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TSPAN13O95857 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TSPAN13O95857 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TSPAN13O95857 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TSPAN13O95857 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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TSPAN13O95857 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TSPAN13O95857 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
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TSPAN13O95857 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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TSPAN13O95857 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TSPAN13O95857 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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TSPAN13O95857 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TSPAN13O95857 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TSPAN13O95857 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TSPAN13O95857 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TSPAN13O95857 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TSPAN13O95857 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TSPAN13O95857 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TSPAN13O95857 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
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TSPAN13O95857 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TSPAN13O95857 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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