Protein–RNA interactions for Protein: O75884

RBBP9, Putative hydrolase RBBP9, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP9O75884 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RBBP9O75884 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 247.7 ms