Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6X4

FAM169A, Soluble lamin-associated protein of 75 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM169AQ9Y6X4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
FAM169AQ9Y6X4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FAM169AQ9Y6X4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FAM169AQ9Y6X4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FAM169AQ9Y6X4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FAM169AQ9Y6X4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FAM169AQ9Y6X4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FAM169AQ9Y6X4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FAM169AQ9Y6X4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FAM169AQ9Y6X4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FAM169AQ9Y6X4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FAM169AQ9Y6X4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FAM169AQ9Y6X4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FAM169AQ9Y6X4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FAM169AQ9Y6X4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FAM169AQ9Y6X4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FAM169AQ9Y6X4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FAM169AQ9Y6X4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FAM169AQ9Y6X4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FAM169AQ9Y6X4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
FAM169AQ9Y6X4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FAM169AQ9Y6X4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
FAM169AQ9Y6X4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FAM169AQ9Y6X4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FAM169AQ9Y6X4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FAM169AQ9Y6X4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FAM169AQ9Y6X4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FAM169AQ9Y6X4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FAM169AQ9Y6X4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FAM169AQ9Y6X4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FAM169AQ9Y6X4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FAM169AQ9Y6X4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FAM169AQ9Y6X4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
FAM169AQ9Y6X4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FAM169AQ9Y6X4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FAM169AQ9Y6X4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FAM169AQ9Y6X4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FAM169AQ9Y6X4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FAM169AQ9Y6X4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FAM169AQ9Y6X4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FAM169AQ9Y6X4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
FAM169AQ9Y6X4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
FAM169AQ9Y6X4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FAM169AQ9Y6X4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
FAM169AQ9Y6X4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
FAM169AQ9Y6X4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FAM169AQ9Y6X4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FAM169AQ9Y6X4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FAM169AQ9Y6X4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FAM169AQ9Y6X4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FAM169AQ9Y6X4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FAM169AQ9Y6X4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FAM169AQ9Y6X4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FAM169AQ9Y6X4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FAM169AQ9Y6X4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FAM169AQ9Y6X4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FAM169AQ9Y6X4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FAM169AQ9Y6X4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FAM169AQ9Y6X4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FAM169AQ9Y6X4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FAM169AQ9Y6X4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FAM169AQ9Y6X4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FAM169AQ9Y6X4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FAM169AQ9Y6X4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FAM169AQ9Y6X4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
FAM169AQ9Y6X4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
FAM169AQ9Y6X4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
FAM169AQ9Y6X4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
FAM169AQ9Y6X4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FAM169AQ9Y6X4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FAM169AQ9Y6X4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FAM169AQ9Y6X4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FAM169AQ9Y6X4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FAM169AQ9Y6X4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FAM169AQ9Y6X4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FAM169AQ9Y6X4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FAM169AQ9Y6X4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FAM169AQ9Y6X4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FAM169AQ9Y6X4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FAM169AQ9Y6X4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FAM169AQ9Y6X4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FAM169AQ9Y6X4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FAM169AQ9Y6X4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FAM169AQ9Y6X4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FAM169AQ9Y6X4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FAM169AQ9Y6X4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FAM169AQ9Y6X4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
FAM169AQ9Y6X4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
FAM169AQ9Y6X4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
FAM169AQ9Y6X4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
FAM169AQ9Y6X4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FAM169AQ9Y6X4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FAM169AQ9Y6X4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FAM169AQ9Y6X4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FAM169AQ9Y6X4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FAM169AQ9Y6X4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FAM169AQ9Y6X4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FAM169AQ9Y6X4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
FAM169AQ9Y6X4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FAM169AQ9Y6X4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms