Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y620

RAD54B, DNA repair and recombination protein RAD54B, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54BQ9Y620 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RAD54BQ9Y620 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RAD54BQ9Y620 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RAD54BQ9Y620 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RAD54BQ9Y620 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RAD54BQ9Y620 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RAD54BQ9Y620 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RAD54BQ9Y620 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RAD54BQ9Y620 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RAD54BQ9Y620 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
RAD54BQ9Y620 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RAD54BQ9Y620 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
RAD54BQ9Y620 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RAD54BQ9Y620 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
RAD54BQ9Y620 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RAD54BQ9Y620 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RAD54BQ9Y620 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RAD54BQ9Y620 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RAD54BQ9Y620 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RAD54BQ9Y620 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RAD54BQ9Y620 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RAD54BQ9Y620 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RAD54BQ9Y620 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RAD54BQ9Y620 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RAD54BQ9Y620 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RAD54BQ9Y620 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
RAD54BQ9Y620 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RAD54BQ9Y620 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RAD54BQ9Y620 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RAD54BQ9Y620 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RAD54BQ9Y620 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RAD54BQ9Y620 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RAD54BQ9Y620 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RAD54BQ9Y620 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RAD54BQ9Y620 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAD54BQ9Y620 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAD54BQ9Y620 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAD54BQ9Y620 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAD54BQ9Y620 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAD54BQ9Y620 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAD54BQ9Y620 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAD54BQ9Y620 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAD54BQ9Y620 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAD54BQ9Y620 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAD54BQ9Y620 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAD54BQ9Y620 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RAD54BQ9Y620 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RAD54BQ9Y620 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RAD54BQ9Y620 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RAD54BQ9Y620 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RAD54BQ9Y620 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RAD54BQ9Y620 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RAD54BQ9Y620 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RAD54BQ9Y620 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RAD54BQ9Y620 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RAD54BQ9Y620 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RAD54BQ9Y620 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RAD54BQ9Y620 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.8
RAD54BQ9Y620 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RAD54BQ9Y620 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RAD54BQ9Y620 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RAD54BQ9Y620 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RAD54BQ9Y620 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RAD54BQ9Y620 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RAD54BQ9Y620 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RAD54BQ9Y620 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RAD54BQ9Y620 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RAD54BQ9Y620 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RAD54BQ9Y620 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
RAD54BQ9Y620 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RAD54BQ9Y620 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RAD54BQ9Y620 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
RAD54BQ9Y620 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RAD54BQ9Y620 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RAD54BQ9Y620 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RAD54BQ9Y620 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RAD54BQ9Y620 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RAD54BQ9Y620 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RAD54BQ9Y620 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RAD54BQ9Y620 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RAD54BQ9Y620 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RAD54BQ9Y620 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RAD54BQ9Y620 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RAD54BQ9Y620 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAD54BQ9Y620 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAD54BQ9Y620 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAD54BQ9Y620 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAD54BQ9Y620 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAD54BQ9Y620 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAD54BQ9Y620 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAD54BQ9Y620 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAD54BQ9Y620 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
RAD54BQ9Y620 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RAD54BQ9Y620 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RAD54BQ9Y620 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RAD54BQ9Y620 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RAD54BQ9Y620 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RAD54BQ9Y620 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RAD54BQ9Y620 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RAD54BQ9Y620 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms