Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B9

SUPT16H, FACT complex subunit SPT16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUPT16HQ9Y5B9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
SUPT16HQ9Y5B9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
SUPT16HQ9Y5B9 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
SUPT16HQ9Y5B9 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
SUPT16HQ9Y5B9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
SUPT16HQ9Y5B9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
SUPT16HQ9Y5B9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
SUPT16HQ9Y5B9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
SUPT16HQ9Y5B9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
SUPT16HQ9Y5B9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
SUPT16HQ9Y5B9 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC33.66■■■□□ 2.98
SUPT16HQ9Y5B9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
SUPT16HQ9Y5B9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
SUPT16HQ9Y5B9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
SUPT16HQ9Y5B9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
SUPT16HQ9Y5B9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
SUPT16HQ9Y5B9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
SUPT16HQ9Y5B9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
SUPT16HQ9Y5B9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
SUPT16HQ9Y5B9 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
SUPT16HQ9Y5B9 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
SUPT16HQ9Y5B9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
SUPT16HQ9Y5B9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
SUPT16HQ9Y5B9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
SUPT16HQ9Y5B9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
SUPT16HQ9Y5B9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
SUPT16HQ9Y5B9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
SUPT16HQ9Y5B9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
SUPT16HQ9Y5B9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
SUPT16HQ9Y5B9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
SUPT16HQ9Y5B9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
SUPT16HQ9Y5B9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
SUPT16HQ9Y5B9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
SUPT16HQ9Y5B9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
SUPT16HQ9Y5B9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
SUPT16HQ9Y5B9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
SUPT16HQ9Y5B9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
SUPT16HQ9Y5B9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
SUPT16HQ9Y5B9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
SUPT16HQ9Y5B9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
SUPT16HQ9Y5B9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
SUPT16HQ9Y5B9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
SUPT16HQ9Y5B9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
SUPT16HQ9Y5B9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
SUPT16HQ9Y5B9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
SUPT16HQ9Y5B9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SUPT16HQ9Y5B9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SUPT16HQ9Y5B9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SUPT16HQ9Y5B9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SUPT16HQ9Y5B9 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
SUPT16HQ9Y5B9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
SUPT16HQ9Y5B9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SUPT16HQ9Y5B9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
SUPT16HQ9Y5B9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
SUPT16HQ9Y5B9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
SUPT16HQ9Y5B9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
SUPT16HQ9Y5B9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
SUPT16HQ9Y5B9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
SUPT16HQ9Y5B9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
SUPT16HQ9Y5B9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
SUPT16HQ9Y5B9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
SUPT16HQ9Y5B9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
SUPT16HQ9Y5B9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
SUPT16HQ9Y5B9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
SUPT16HQ9Y5B9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
SUPT16HQ9Y5B9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
SUPT16HQ9Y5B9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
SUPT16HQ9Y5B9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
SUPT16HQ9Y5B9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
SUPT16HQ9Y5B9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
SUPT16HQ9Y5B9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
SUPT16HQ9Y5B9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.94
SUPT16HQ9Y5B9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
SUPT16HQ9Y5B9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
SUPT16HQ9Y5B9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
SUPT16HQ9Y5B9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
SUPT16HQ9Y5B9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
SUPT16HQ9Y5B9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
SUPT16HQ9Y5B9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
SUPT16HQ9Y5B9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
SUPT16HQ9Y5B9 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
SUPT16HQ9Y5B9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
SUPT16HQ9Y5B9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
SUPT16HQ9Y5B9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
SUPT16HQ9Y5B9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
SUPT16HQ9Y5B9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
SUPT16HQ9Y5B9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
SUPT16HQ9Y5B9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
SUPT16HQ9Y5B9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
SUPT16HQ9Y5B9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
SUPT16HQ9Y5B9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
SUPT16HQ9Y5B9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
SUPT16HQ9Y5B9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
SUPT16HQ9Y5B9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
SUPT16HQ9Y5B9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
SUPT16HQ9Y5B9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
SUPT16HQ9Y5B9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
SUPT16HQ9Y5B9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
SUPT16HQ9Y5B9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
SUPT16HQ9Y5B9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms