Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B1

PRELID3B, PRELI domain containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRELID3BQ9Y3B1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRELID3BQ9Y3B1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRELID3BQ9Y3B1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRELID3BQ9Y3B1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRELID3BQ9Y3B1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRELID3BQ9Y3B1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRELID3BQ9Y3B1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PRELID3BQ9Y3B1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRELID3BQ9Y3B1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRELID3BQ9Y3B1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRELID3BQ9Y3B1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRELID3BQ9Y3B1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRELID3BQ9Y3B1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRELID3BQ9Y3B1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRELID3BQ9Y3B1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRELID3BQ9Y3B1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
PRELID3BQ9Y3B1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
PRELID3BQ9Y3B1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PRELID3BQ9Y3B1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PRELID3BQ9Y3B1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRELID3BQ9Y3B1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRELID3BQ9Y3B1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRELID3BQ9Y3B1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRELID3BQ9Y3B1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRELID3BQ9Y3B1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PRELID3BQ9Y3B1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRELID3BQ9Y3B1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRELID3BQ9Y3B1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRELID3BQ9Y3B1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRELID3BQ9Y3B1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRELID3BQ9Y3B1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRELID3BQ9Y3B1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRELID3BQ9Y3B1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRELID3BQ9Y3B1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRELID3BQ9Y3B1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRELID3BQ9Y3B1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRELID3BQ9Y3B1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRELID3BQ9Y3B1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRELID3BQ9Y3B1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRELID3BQ9Y3B1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRELID3BQ9Y3B1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRELID3BQ9Y3B1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRELID3BQ9Y3B1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRELID3BQ9Y3B1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRELID3BQ9Y3B1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRELID3BQ9Y3B1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PRELID3BQ9Y3B1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PRELID3BQ9Y3B1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PRELID3BQ9Y3B1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PRELID3BQ9Y3B1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PRELID3BQ9Y3B1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PRELID3BQ9Y3B1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PRELID3BQ9Y3B1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PRELID3BQ9Y3B1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PRELID3BQ9Y3B1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PRELID3BQ9Y3B1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PRELID3BQ9Y3B1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PRELID3BQ9Y3B1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PRELID3BQ9Y3B1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PRELID3BQ9Y3B1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PRELID3BQ9Y3B1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRELID3BQ9Y3B1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRELID3BQ9Y3B1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRELID3BQ9Y3B1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRELID3BQ9Y3B1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRELID3BQ9Y3B1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PRELID3BQ9Y3B1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PRELID3BQ9Y3B1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PRELID3BQ9Y3B1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PRELID3BQ9Y3B1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PRELID3BQ9Y3B1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PRELID3BQ9Y3B1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRELID3BQ9Y3B1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRELID3BQ9Y3B1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRELID3BQ9Y3B1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PRELID3BQ9Y3B1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PRELID3BQ9Y3B1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PRELID3BQ9Y3B1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PRELID3BQ9Y3B1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PRELID3BQ9Y3B1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRELID3BQ9Y3B1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRELID3BQ9Y3B1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRELID3BQ9Y3B1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRELID3BQ9Y3B1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRELID3BQ9Y3B1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRELID3BQ9Y3B1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PRELID3BQ9Y3B1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PRELID3BQ9Y3B1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PRELID3BQ9Y3B1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PRELID3BQ9Y3B1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PRELID3BQ9Y3B1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PRELID3BQ9Y3B1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PRELID3BQ9Y3B1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PRELID3BQ9Y3B1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PRELID3BQ9Y3B1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PRELID3BQ9Y3B1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PRELID3BQ9Y3B1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PRELID3BQ9Y3B1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PRELID3BQ9Y3B1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PRELID3BQ9Y3B1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms