Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y251

HPSE, Heparanase, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPSEQ9Y251 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
HPSEQ9Y251 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
HPSEQ9Y251 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
HPSEQ9Y251 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HPSEQ9Y251 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HPSEQ9Y251 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HPSEQ9Y251 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
HPSEQ9Y251 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
HPSEQ9Y251 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
HPSEQ9Y251 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
HPSEQ9Y251 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
HPSEQ9Y251 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
HPSEQ9Y251 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
HPSEQ9Y251 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
HPSEQ9Y251 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
HPSEQ9Y251 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
HPSEQ9Y251 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HPSEQ9Y251 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
HPSEQ9Y251 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
HPSEQ9Y251 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
HPSEQ9Y251 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
HPSEQ9Y251 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
HPSEQ9Y251 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HPSEQ9Y251 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HPSEQ9Y251 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
HPSEQ9Y251 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
HPSEQ9Y251 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
HPSEQ9Y251 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
HPSEQ9Y251 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
HPSEQ9Y251 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
HPSEQ9Y251 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
HPSEQ9Y251 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
HPSEQ9Y251 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
HPSEQ9Y251 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
HPSEQ9Y251 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
HPSEQ9Y251 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
HPSEQ9Y251 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.17
HPSEQ9Y251 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
HPSEQ9Y251 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
HPSEQ9Y251 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
HPSEQ9Y251 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
HPSEQ9Y251 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
HPSEQ9Y251 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
HPSEQ9Y251 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
HPSEQ9Y251 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
HPSEQ9Y251 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
HPSEQ9Y251 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
HPSEQ9Y251 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
HPSEQ9Y251 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
HPSEQ9Y251 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
HPSEQ9Y251 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
HPSEQ9Y251 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
HPSEQ9Y251 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
HPSEQ9Y251 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
HPSEQ9Y251 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
HPSEQ9Y251 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
HPSEQ9Y251 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HPSEQ9Y251 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HPSEQ9Y251 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HPSEQ9Y251 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
HPSEQ9Y251 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
HPSEQ9Y251 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
HPSEQ9Y251 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
HPSEQ9Y251 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
HPSEQ9Y251 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
HPSEQ9Y251 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
HPSEQ9Y251 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
HPSEQ9Y251 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
HPSEQ9Y251 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
HPSEQ9Y251 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
HPSEQ9Y251 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
HPSEQ9Y251 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
HPSEQ9Y251 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
HPSEQ9Y251 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
HPSEQ9Y251 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
HPSEQ9Y251 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
HPSEQ9Y251 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
HPSEQ9Y251 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HPSEQ9Y251 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
HPSEQ9Y251 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
HPSEQ9Y251 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
HPSEQ9Y251 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
HPSEQ9Y251 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
HPSEQ9Y251 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
HPSEQ9Y251 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
HPSEQ9Y251 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
HPSEQ9Y251 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
HPSEQ9Y251 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
HPSEQ9Y251 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
HPSEQ9Y251 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
HPSEQ9Y251 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HPSEQ9Y251 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
HPSEQ9Y251 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
HPSEQ9Y251 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
HPSEQ9Y251 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
HPSEQ9Y251 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
HPSEQ9Y251 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
HPSEQ9Y251 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
HPSEQ9Y251 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
HPSEQ9Y251 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms