Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC12A4Q9UP95 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC12A4Q9UP95 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC12A4Q9UP95 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC12A4Q9UP95 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC12A4Q9UP95 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC12A4Q9UP95 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC12A4Q9UP95 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC12A4Q9UP95 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC12A4Q9UP95 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC12A4Q9UP95 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC12A4Q9UP95 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC12A4Q9UP95 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC12A4Q9UP95 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC12A4Q9UP95 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC12A4Q9UP95 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC12A4Q9UP95 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC12A4Q9UP95 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC12A4Q9UP95 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC12A4Q9UP95 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC12A4Q9UP95 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC12A4Q9UP95 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC12A4Q9UP95 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC12A4Q9UP95 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC12A4Q9UP95 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC12A4Q9UP95 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC12A4Q9UP95 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC12A4Q9UP95 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC12A4Q9UP95 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC12A4Q9UP95 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC12A4Q9UP95 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC12A4Q9UP95 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC12A4Q9UP95 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC12A4Q9UP95 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC12A4Q9UP95 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC12A4Q9UP95 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC12A4Q9UP95 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SLC12A4Q9UP95 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SLC12A4Q9UP95 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SLC12A4Q9UP95 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC12A4Q9UP95 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC12A4Q9UP95 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC12A4Q9UP95 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC12A4Q9UP95 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC12A4Q9UP95 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC12A4Q9UP95 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC12A4Q9UP95 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC12A4Q9UP95 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC12A4Q9UP95 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC12A4Q9UP95 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC12A4Q9UP95 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC12A4Q9UP95 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC12A4Q9UP95 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC12A4Q9UP95 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC12A4Q9UP95 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC12A4Q9UP95 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC12A4Q9UP95 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC12A4Q9UP95 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC12A4Q9UP95 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC12A4Q9UP95 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC12A4Q9UP95 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC12A4Q9UP95 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC12A4Q9UP95 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC12A4Q9UP95 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC12A4Q9UP95 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC12A4Q9UP95 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC12A4Q9UP95 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC12A4Q9UP95 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC12A4Q9UP95 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC12A4Q9UP95 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC12A4Q9UP95 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC12A4Q9UP95 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC12A4Q9UP95 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC12A4Q9UP95 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC12A4Q9UP95 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC12A4Q9UP95 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC12A4Q9UP95 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC12A4Q9UP95 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC12A4Q9UP95 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC12A4Q9UP95 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC12A4Q9UP95 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC12A4Q9UP95 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC12A4Q9UP95 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC12A4Q9UP95 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC12A4Q9UP95 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC12A4Q9UP95 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC12A4Q9UP95 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC12A4Q9UP95 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC12A4Q9UP95 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC12A4Q9UP95 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC12A4Q9UP95 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC12A4Q9UP95 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC12A4Q9UP95 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC12A4Q9UP95 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC12A4Q9UP95 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC12A4Q9UP95 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC12A4Q9UP95 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC12A4Q9UP95 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC12A4Q9UP95 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC12A4Q9UP95 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 155.4 ms