Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMY4

SNX12, Sorting nexin-12, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX12Q9UMY4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SNX12Q9UMY4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SNX12Q9UMY4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SNX12Q9UMY4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SNX12Q9UMY4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SNX12Q9UMY4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SNX12Q9UMY4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SNX12Q9UMY4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
SNX12Q9UMY4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SNX12Q9UMY4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SNX12Q9UMY4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SNX12Q9UMY4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SNX12Q9UMY4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SNX12Q9UMY4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SNX12Q9UMY4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SNX12Q9UMY4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SNX12Q9UMY4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SNX12Q9UMY4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SNX12Q9UMY4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SNX12Q9UMY4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SNX12Q9UMY4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SNX12Q9UMY4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SNX12Q9UMY4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SNX12Q9UMY4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SNX12Q9UMY4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SNX12Q9UMY4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SNX12Q9UMY4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SNX12Q9UMY4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SNX12Q9UMY4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SNX12Q9UMY4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SNX12Q9UMY4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SNX12Q9UMY4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SNX12Q9UMY4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SNX12Q9UMY4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SNX12Q9UMY4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SNX12Q9UMY4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SNX12Q9UMY4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SNX12Q9UMY4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SNX12Q9UMY4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SNX12Q9UMY4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SNX12Q9UMY4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SNX12Q9UMY4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SNX12Q9UMY4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SNX12Q9UMY4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SNX12Q9UMY4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SNX12Q9UMY4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SNX12Q9UMY4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SNX12Q9UMY4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SNX12Q9UMY4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SNX12Q9UMY4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SNX12Q9UMY4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SNX12Q9UMY4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SNX12Q9UMY4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SNX12Q9UMY4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SNX12Q9UMY4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SNX12Q9UMY4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SNX12Q9UMY4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SNX12Q9UMY4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SNX12Q9UMY4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SNX12Q9UMY4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SNX12Q9UMY4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SNX12Q9UMY4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SNX12Q9UMY4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SNX12Q9UMY4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SNX12Q9UMY4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SNX12Q9UMY4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SNX12Q9UMY4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SNX12Q9UMY4 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SNX12Q9UMY4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SNX12Q9UMY4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SNX12Q9UMY4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SNX12Q9UMY4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SNX12Q9UMY4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SNX12Q9UMY4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SNX12Q9UMY4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SNX12Q9UMY4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SNX12Q9UMY4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SNX12Q9UMY4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SNX12Q9UMY4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SNX12Q9UMY4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SNX12Q9UMY4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SNX12Q9UMY4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SNX12Q9UMY4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SNX12Q9UMY4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SNX12Q9UMY4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SNX12Q9UMY4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SNX12Q9UMY4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SNX12Q9UMY4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SNX12Q9UMY4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SNX12Q9UMY4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SNX12Q9UMY4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SNX12Q9UMY4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SNX12Q9UMY4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SNX12Q9UMY4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SNX12Q9UMY4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SNX12Q9UMY4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SNX12Q9UMY4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SNX12Q9UMY4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SNX12Q9UMY4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SNX12Q9UMY4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms