Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEU0

VTI1B, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1BQ9UEU0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
VTI1BQ9UEU0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
VTI1BQ9UEU0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VTI1BQ9UEU0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VTI1BQ9UEU0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VTI1BQ9UEU0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VTI1BQ9UEU0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VTI1BQ9UEU0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VTI1BQ9UEU0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VTI1BQ9UEU0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VTI1BQ9UEU0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VTI1BQ9UEU0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VTI1BQ9UEU0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VTI1BQ9UEU0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VTI1BQ9UEU0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VTI1BQ9UEU0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VTI1BQ9UEU0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VTI1BQ9UEU0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VTI1BQ9UEU0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VTI1BQ9UEU0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VTI1BQ9UEU0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VTI1BQ9UEU0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VTI1BQ9UEU0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VTI1BQ9UEU0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VTI1BQ9UEU0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VTI1BQ9UEU0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VTI1BQ9UEU0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VTI1BQ9UEU0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VTI1BQ9UEU0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VTI1BQ9UEU0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VTI1BQ9UEU0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VTI1BQ9UEU0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
VTI1BQ9UEU0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
VTI1BQ9UEU0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VTI1BQ9UEU0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VTI1BQ9UEU0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
VTI1BQ9UEU0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VTI1BQ9UEU0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VTI1BQ9UEU0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
VTI1BQ9UEU0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VTI1BQ9UEU0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VTI1BQ9UEU0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VTI1BQ9UEU0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VTI1BQ9UEU0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VTI1BQ9UEU0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VTI1BQ9UEU0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VTI1BQ9UEU0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VTI1BQ9UEU0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VTI1BQ9UEU0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VTI1BQ9UEU0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VTI1BQ9UEU0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VTI1BQ9UEU0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VTI1BQ9UEU0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VTI1BQ9UEU0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VTI1BQ9UEU0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VTI1BQ9UEU0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VTI1BQ9UEU0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VTI1BQ9UEU0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VTI1BQ9UEU0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VTI1BQ9UEU0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VTI1BQ9UEU0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VTI1BQ9UEU0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VTI1BQ9UEU0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VTI1BQ9UEU0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VTI1BQ9UEU0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VTI1BQ9UEU0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VTI1BQ9UEU0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VTI1BQ9UEU0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VTI1BQ9UEU0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VTI1BQ9UEU0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VTI1BQ9UEU0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
VTI1BQ9UEU0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VTI1BQ9UEU0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VTI1BQ9UEU0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VTI1BQ9UEU0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VTI1BQ9UEU0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
VTI1BQ9UEU0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VTI1BQ9UEU0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VTI1BQ9UEU0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VTI1BQ9UEU0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VTI1BQ9UEU0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VTI1BQ9UEU0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VTI1BQ9UEU0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VTI1BQ9UEU0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VTI1BQ9UEU0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VTI1BQ9UEU0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VTI1BQ9UEU0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VTI1BQ9UEU0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VTI1BQ9UEU0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VTI1BQ9UEU0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VTI1BQ9UEU0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VTI1BQ9UEU0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VTI1BQ9UEU0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VTI1BQ9UEU0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VTI1BQ9UEU0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VTI1BQ9UEU0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
VTI1BQ9UEU0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VTI1BQ9UEU0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VTI1BQ9UEU0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VTI1BQ9UEU0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms