Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY8

CLN8, Protein CLN8, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8Q9UBY8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLN8Q9UBY8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLN8Q9UBY8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLN8Q9UBY8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLN8Q9UBY8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLN8Q9UBY8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLN8Q9UBY8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLN8Q9UBY8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLN8Q9UBY8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLN8Q9UBY8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLN8Q9UBY8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLN8Q9UBY8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLN8Q9UBY8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLN8Q9UBY8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLN8Q9UBY8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLN8Q9UBY8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLN8Q9UBY8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLN8Q9UBY8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLN8Q9UBY8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CLN8Q9UBY8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLN8Q9UBY8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLN8Q9UBY8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLN8Q9UBY8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLN8Q9UBY8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CLN8Q9UBY8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CLN8Q9UBY8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CLN8Q9UBY8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CLN8Q9UBY8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLN8Q9UBY8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CLN8Q9UBY8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLN8Q9UBY8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLN8Q9UBY8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CLN8Q9UBY8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CLN8Q9UBY8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CLN8Q9UBY8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLN8Q9UBY8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLN8Q9UBY8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLN8Q9UBY8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLN8Q9UBY8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CLN8Q9UBY8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLN8Q9UBY8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLN8Q9UBY8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLN8Q9UBY8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLN8Q9UBY8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CLN8Q9UBY8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLN8Q9UBY8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CLN8Q9UBY8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLN8Q9UBY8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CLN8Q9UBY8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLN8Q9UBY8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
CLN8Q9UBY8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CLN8Q9UBY8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CLN8Q9UBY8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLN8Q9UBY8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CLN8Q9UBY8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CLN8Q9UBY8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLN8Q9UBY8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLN8Q9UBY8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLN8Q9UBY8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLN8Q9UBY8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLN8Q9UBY8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLN8Q9UBY8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLN8Q9UBY8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CLN8Q9UBY8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLN8Q9UBY8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLN8Q9UBY8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLN8Q9UBY8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLN8Q9UBY8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLN8Q9UBY8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLN8Q9UBY8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLN8Q9UBY8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLN8Q9UBY8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLN8Q9UBY8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLN8Q9UBY8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLN8Q9UBY8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CLN8Q9UBY8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLN8Q9UBY8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLN8Q9UBY8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLN8Q9UBY8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLN8Q9UBY8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLN8Q9UBY8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CLN8Q9UBY8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLN8Q9UBY8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLN8Q9UBY8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLN8Q9UBY8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CLN8Q9UBY8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLN8Q9UBY8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLN8Q9UBY8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLN8Q9UBY8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLN8Q9UBY8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLN8Q9UBY8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLN8Q9UBY8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLN8Q9UBY8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLN8Q9UBY8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLN8Q9UBY8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLN8Q9UBY8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLN8Q9UBY8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLN8Q9UBY8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLN8Q9UBY8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLN8Q9UBY8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.9 ms