Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBA6

C6orf48, Protein G8, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf48Q9UBA6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C6orf48Q9UBA6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C6orf48Q9UBA6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C6orf48Q9UBA6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C6orf48Q9UBA6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C6orf48Q9UBA6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C6orf48Q9UBA6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C6orf48Q9UBA6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C6orf48Q9UBA6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
C6orf48Q9UBA6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C6orf48Q9UBA6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C6orf48Q9UBA6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C6orf48Q9UBA6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C6orf48Q9UBA6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C6orf48Q9UBA6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C6orf48Q9UBA6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C6orf48Q9UBA6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C6orf48Q9UBA6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C6orf48Q9UBA6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C6orf48Q9UBA6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C6orf48Q9UBA6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C6orf48Q9UBA6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C6orf48Q9UBA6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C6orf48Q9UBA6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C6orf48Q9UBA6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C6orf48Q9UBA6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
C6orf48Q9UBA6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
C6orf48Q9UBA6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C6orf48Q9UBA6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C6orf48Q9UBA6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C6orf48Q9UBA6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C6orf48Q9UBA6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
C6orf48Q9UBA6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C6orf48Q9UBA6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C6orf48Q9UBA6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C6orf48Q9UBA6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C6orf48Q9UBA6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C6orf48Q9UBA6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C6orf48Q9UBA6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C6orf48Q9UBA6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C6orf48Q9UBA6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C6orf48Q9UBA6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C6orf48Q9UBA6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C6orf48Q9UBA6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C6orf48Q9UBA6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
C6orf48Q9UBA6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C6orf48Q9UBA6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
C6orf48Q9UBA6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C6orf48Q9UBA6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C6orf48Q9UBA6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C6orf48Q9UBA6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C6orf48Q9UBA6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
C6orf48Q9UBA6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
C6orf48Q9UBA6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C6orf48Q9UBA6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C6orf48Q9UBA6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C6orf48Q9UBA6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C6orf48Q9UBA6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C6orf48Q9UBA6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C6orf48Q9UBA6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C6orf48Q9UBA6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C6orf48Q9UBA6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C6orf48Q9UBA6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
C6orf48Q9UBA6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C6orf48Q9UBA6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C6orf48Q9UBA6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C6orf48Q9UBA6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C6orf48Q9UBA6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C6orf48Q9UBA6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C6orf48Q9UBA6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C6orf48Q9UBA6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C6orf48Q9UBA6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C6orf48Q9UBA6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C6orf48Q9UBA6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C6orf48Q9UBA6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C6orf48Q9UBA6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C6orf48Q9UBA6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C6orf48Q9UBA6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C6orf48Q9UBA6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C6orf48Q9UBA6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C6orf48Q9UBA6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C6orf48Q9UBA6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C6orf48Q9UBA6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
C6orf48Q9UBA6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C6orf48Q9UBA6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C6orf48Q9UBA6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C6orf48Q9UBA6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C6orf48Q9UBA6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C6orf48Q9UBA6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C6orf48Q9UBA6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C6orf48Q9UBA6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C6orf48Q9UBA6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C6orf48Q9UBA6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C6orf48Q9UBA6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C6orf48Q9UBA6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C6orf48Q9UBA6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C6orf48Q9UBA6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C6orf48Q9UBA6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C6orf48Q9UBA6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C6orf48Q9UBA6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms