Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2W1

PSMC3IP, Homologous-pairing protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC3IPQ9P2W1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PSMC3IPQ9P2W1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PSMC3IPQ9P2W1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PSMC3IPQ9P2W1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PSMC3IPQ9P2W1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PSMC3IPQ9P2W1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PSMC3IPQ9P2W1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PSMC3IPQ9P2W1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PSMC3IPQ9P2W1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PSMC3IPQ9P2W1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PSMC3IPQ9P2W1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PSMC3IPQ9P2W1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PSMC3IPQ9P2W1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PSMC3IPQ9P2W1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PSMC3IPQ9P2W1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PSMC3IPQ9P2W1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PSMC3IPQ9P2W1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PSMC3IPQ9P2W1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PSMC3IPQ9P2W1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PSMC3IPQ9P2W1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSMC3IPQ9P2W1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSMC3IPQ9P2W1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSMC3IPQ9P2W1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSMC3IPQ9P2W1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSMC3IPQ9P2W1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSMC3IPQ9P2W1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PSMC3IPQ9P2W1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PSMC3IPQ9P2W1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PSMC3IPQ9P2W1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PSMC3IPQ9P2W1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PSMC3IPQ9P2W1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PSMC3IPQ9P2W1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PSMC3IPQ9P2W1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PSMC3IPQ9P2W1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PSMC3IPQ9P2W1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PSMC3IPQ9P2W1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PSMC3IPQ9P2W1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PSMC3IPQ9P2W1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PSMC3IPQ9P2W1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PSMC3IPQ9P2W1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PSMC3IPQ9P2W1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PSMC3IPQ9P2W1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PSMC3IPQ9P2W1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PSMC3IPQ9P2W1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PSMC3IPQ9P2W1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PSMC3IPQ9P2W1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PSMC3IPQ9P2W1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSMC3IPQ9P2W1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSMC3IPQ9P2W1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSMC3IPQ9P2W1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSMC3IPQ9P2W1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSMC3IPQ9P2W1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSMC3IPQ9P2W1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSMC3IPQ9P2W1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSMC3IPQ9P2W1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSMC3IPQ9P2W1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSMC3IPQ9P2W1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSMC3IPQ9P2W1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PSMC3IPQ9P2W1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSMC3IPQ9P2W1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PSMC3IPQ9P2W1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSMC3IPQ9P2W1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSMC3IPQ9P2W1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSMC3IPQ9P2W1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PSMC3IPQ9P2W1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PSMC3IPQ9P2W1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PSMC3IPQ9P2W1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PSMC3IPQ9P2W1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSMC3IPQ9P2W1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSMC3IPQ9P2W1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSMC3IPQ9P2W1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSMC3IPQ9P2W1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSMC3IPQ9P2W1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSMC3IPQ9P2W1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSMC3IPQ9P2W1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSMC3IPQ9P2W1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSMC3IPQ9P2W1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSMC3IPQ9P2W1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSMC3IPQ9P2W1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSMC3IPQ9P2W1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSMC3IPQ9P2W1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSMC3IPQ9P2W1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSMC3IPQ9P2W1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSMC3IPQ9P2W1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSMC3IPQ9P2W1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSMC3IPQ9P2W1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSMC3IPQ9P2W1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSMC3IPQ9P2W1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PSMC3IPQ9P2W1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSMC3IPQ9P2W1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSMC3IPQ9P2W1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSMC3IPQ9P2W1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PSMC3IPQ9P2W1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSMC3IPQ9P2W1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSMC3IPQ9P2W1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSMC3IPQ9P2W1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSMC3IPQ9P2W1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSMC3IPQ9P2W1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSMC3IPQ9P2W1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSMC3IPQ9P2W1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms