Protein–RNA interactions for Protein: Q9P253

VPS18, Vacuolar protein sorting-associated protein 18 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 973 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS18Q9P253 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
VPS18Q9P253 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
VPS18Q9P253 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
VPS18Q9P253 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
VPS18Q9P253 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
VPS18Q9P253 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
VPS18Q9P253 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
VPS18Q9P253 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
VPS18Q9P253 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
VPS18Q9P253 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
VPS18Q9P253 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
VPS18Q9P253 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
VPS18Q9P253 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
VPS18Q9P253 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
VPS18Q9P253 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
VPS18Q9P253 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
VPS18Q9P253 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
VPS18Q9P253 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
VPS18Q9P253 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
VPS18Q9P253 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
VPS18Q9P253 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
VPS18Q9P253 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
VPS18Q9P253 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
VPS18Q9P253 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
VPS18Q9P253 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
VPS18Q9P253 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
VPS18Q9P253 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
VPS18Q9P253 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
VPS18Q9P253 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
VPS18Q9P253 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
VPS18Q9P253 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
VPS18Q9P253 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
VPS18Q9P253 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
VPS18Q9P253 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
VPS18Q9P253 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
VPS18Q9P253 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
VPS18Q9P253 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
VPS18Q9P253 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
VPS18Q9P253 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
VPS18Q9P253 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
VPS18Q9P253 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
VPS18Q9P253 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
VPS18Q9P253 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
VPS18Q9P253 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
VPS18Q9P253 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
VPS18Q9P253 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
VPS18Q9P253 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
VPS18Q9P253 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
VPS18Q9P253 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
VPS18Q9P253 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
VPS18Q9P253 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
VPS18Q9P253 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
VPS18Q9P253 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
VPS18Q9P253 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
VPS18Q9P253 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
VPS18Q9P253 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
VPS18Q9P253 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
VPS18Q9P253 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
VPS18Q9P253 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
VPS18Q9P253 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VPS18Q9P253 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VPS18Q9P253 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VPS18Q9P253 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VPS18Q9P253 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
VPS18Q9P253 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
VPS18Q9P253 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
VPS18Q9P253 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
VPS18Q9P253 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
VPS18Q9P253 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
VPS18Q9P253 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
VPS18Q9P253 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
VPS18Q9P253 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
VPS18Q9P253 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
VPS18Q9P253 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
VPS18Q9P253 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
VPS18Q9P253 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
VPS18Q9P253 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
VPS18Q9P253 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
VPS18Q9P253 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VPS18Q9P253 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VPS18Q9P253 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VPS18Q9P253 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VPS18Q9P253 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VPS18Q9P253 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
VPS18Q9P253 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
VPS18Q9P253 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
VPS18Q9P253 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
VPS18Q9P253 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
VPS18Q9P253 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
VPS18Q9P253 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
VPS18Q9P253 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
VPS18Q9P253 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
VPS18Q9P253 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
VPS18Q9P253 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
VPS18Q9P253 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
VPS18Q9P253 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
VPS18Q9P253 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
VPS18Q9P253 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
VPS18Q9P253 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
VPS18Q9P253 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms