Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W0

IFNK, Interferon kappa, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNKQ9P0W0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
IFNKQ9P0W0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
IFNKQ9P0W0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
IFNKQ9P0W0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
IFNKQ9P0W0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
IFNKQ9P0W0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
IFNKQ9P0W0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
IFNKQ9P0W0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
IFNKQ9P0W0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
IFNKQ9P0W0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
IFNKQ9P0W0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
IFNKQ9P0W0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
IFNKQ9P0W0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
IFNKQ9P0W0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
IFNKQ9P0W0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
IFNKQ9P0W0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
IFNKQ9P0W0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
IFNKQ9P0W0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
IFNKQ9P0W0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
IFNKQ9P0W0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
IFNKQ9P0W0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
IFNKQ9P0W0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
IFNKQ9P0W0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
IFNKQ9P0W0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
IFNKQ9P0W0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
IFNKQ9P0W0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
IFNKQ9P0W0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
IFNKQ9P0W0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
IFNKQ9P0W0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
IFNKQ9P0W0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
IFNKQ9P0W0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
IFNKQ9P0W0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
IFNKQ9P0W0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
IFNKQ9P0W0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
IFNKQ9P0W0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
IFNKQ9P0W0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
IFNKQ9P0W0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
IFNKQ9P0W0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
IFNKQ9P0W0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
IFNKQ9P0W0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
IFNKQ9P0W0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
IFNKQ9P0W0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
IFNKQ9P0W0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
IFNKQ9P0W0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
IFNKQ9P0W0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
IFNKQ9P0W0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
IFNKQ9P0W0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
IFNKQ9P0W0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
IFNKQ9P0W0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
IFNKQ9P0W0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
IFNKQ9P0W0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
IFNKQ9P0W0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
IFNKQ9P0W0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
IFNKQ9P0W0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
IFNKQ9P0W0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
IFNKQ9P0W0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
IFNKQ9P0W0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
IFNKQ9P0W0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
IFNKQ9P0W0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
IFNKQ9P0W0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
IFNKQ9P0W0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
IFNKQ9P0W0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
IFNKQ9P0W0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
IFNKQ9P0W0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
IFNKQ9P0W0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
IFNKQ9P0W0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
IFNKQ9P0W0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
IFNKQ9P0W0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
IFNKQ9P0W0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
IFNKQ9P0W0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
IFNKQ9P0W0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
IFNKQ9P0W0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
IFNKQ9P0W0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
IFNKQ9P0W0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
IFNKQ9P0W0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
IFNKQ9P0W0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
IFNKQ9P0W0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
IFNKQ9P0W0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
IFNKQ9P0W0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
IFNKQ9P0W0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
IFNKQ9P0W0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
IFNKQ9P0W0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
IFNKQ9P0W0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
IFNKQ9P0W0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
IFNKQ9P0W0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
IFNKQ9P0W0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
IFNKQ9P0W0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
IFNKQ9P0W0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
IFNKQ9P0W0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
IFNKQ9P0W0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
IFNKQ9P0W0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
IFNKQ9P0W0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
IFNKQ9P0W0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
IFNKQ9P0W0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
IFNKQ9P0W0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
IFNKQ9P0W0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
IFNKQ9P0W0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
IFNKQ9P0W0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
IFNKQ9P0W0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
IFNKQ9P0W0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms