Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUG4

CCM2L, Cerebral cavernous malformations 2 protein-like, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCM2LQ9NUG4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCM2LQ9NUG4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCM2LQ9NUG4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCM2LQ9NUG4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCM2LQ9NUG4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCM2LQ9NUG4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCM2LQ9NUG4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCM2LQ9NUG4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CCM2LQ9NUG4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCM2LQ9NUG4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCM2LQ9NUG4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCM2LQ9NUG4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCM2LQ9NUG4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CCM2LQ9NUG4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCM2LQ9NUG4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCM2LQ9NUG4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCM2LQ9NUG4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCM2LQ9NUG4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCM2LQ9NUG4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCM2LQ9NUG4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCM2LQ9NUG4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCM2LQ9NUG4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCM2LQ9NUG4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCM2LQ9NUG4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CCM2LQ9NUG4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCM2LQ9NUG4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCM2LQ9NUG4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCM2LQ9NUG4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCM2LQ9NUG4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCM2LQ9NUG4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCM2LQ9NUG4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCM2LQ9NUG4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCM2LQ9NUG4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCM2LQ9NUG4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCM2LQ9NUG4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCM2LQ9NUG4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCM2LQ9NUG4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CCM2LQ9NUG4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCM2LQ9NUG4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCM2LQ9NUG4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCM2LQ9NUG4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCM2LQ9NUG4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCM2LQ9NUG4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCM2LQ9NUG4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CCM2LQ9NUG4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCM2LQ9NUG4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCM2LQ9NUG4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCM2LQ9NUG4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCM2LQ9NUG4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCM2LQ9NUG4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCM2LQ9NUG4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCM2LQ9NUG4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCM2LQ9NUG4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCM2LQ9NUG4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCM2LQ9NUG4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCM2LQ9NUG4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCM2LQ9NUG4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CCM2LQ9NUG4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCM2LQ9NUG4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCM2LQ9NUG4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCM2LQ9NUG4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCM2LQ9NUG4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCM2LQ9NUG4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCM2LQ9NUG4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCM2LQ9NUG4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCM2LQ9NUG4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCM2LQ9NUG4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCM2LQ9NUG4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCM2LQ9NUG4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCM2LQ9NUG4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCM2LQ9NUG4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCM2LQ9NUG4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCM2LQ9NUG4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCM2LQ9NUG4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCM2LQ9NUG4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCM2LQ9NUG4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCM2LQ9NUG4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCM2LQ9NUG4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCM2LQ9NUG4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCM2LQ9NUG4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCM2LQ9NUG4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCM2LQ9NUG4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCM2LQ9NUG4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCM2LQ9NUG4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCM2LQ9NUG4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCM2LQ9NUG4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCM2LQ9NUG4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CCM2LQ9NUG4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCM2LQ9NUG4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCM2LQ9NUG4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCM2LQ9NUG4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCM2LQ9NUG4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCM2LQ9NUG4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCM2LQ9NUG4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCM2LQ9NUG4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CCM2LQ9NUG4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCM2LQ9NUG4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CCM2LQ9NUG4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCM2LQ9NUG4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCM2LQ9NUG4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms