Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS71

GKN1, Gastrokine-1, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKN1Q9NS71 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GKN1Q9NS71 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GKN1Q9NS71 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GKN1Q9NS71 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GKN1Q9NS71 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GKN1Q9NS71 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GKN1Q9NS71 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GKN1Q9NS71 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GKN1Q9NS71 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GKN1Q9NS71 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GKN1Q9NS71 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GKN1Q9NS71 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GKN1Q9NS71 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
GKN1Q9NS71 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GKN1Q9NS71 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GKN1Q9NS71 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GKN1Q9NS71 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GKN1Q9NS71 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GKN1Q9NS71 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GKN1Q9NS71 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GKN1Q9NS71 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GKN1Q9NS71 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GKN1Q9NS71 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GKN1Q9NS71 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GKN1Q9NS71 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GKN1Q9NS71 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
GKN1Q9NS71 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GKN1Q9NS71 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GKN1Q9NS71 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GKN1Q9NS71 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
GKN1Q9NS71 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GKN1Q9NS71 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GKN1Q9NS71 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
GKN1Q9NS71 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
GKN1Q9NS71 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GKN1Q9NS71 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GKN1Q9NS71 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GKN1Q9NS71 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GKN1Q9NS71 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GKN1Q9NS71 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GKN1Q9NS71 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GKN1Q9NS71 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GKN1Q9NS71 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GKN1Q9NS71 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GKN1Q9NS71 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GKN1Q9NS71 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GKN1Q9NS71 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GKN1Q9NS71 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GKN1Q9NS71 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GKN1Q9NS71 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GKN1Q9NS71 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GKN1Q9NS71 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GKN1Q9NS71 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GKN1Q9NS71 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GKN1Q9NS71 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GKN1Q9NS71 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GKN1Q9NS71 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GKN1Q9NS71 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GKN1Q9NS71 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GKN1Q9NS71 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GKN1Q9NS71 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GKN1Q9NS71 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GKN1Q9NS71 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GKN1Q9NS71 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GKN1Q9NS71 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GKN1Q9NS71 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GKN1Q9NS71 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GKN1Q9NS71 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GKN1Q9NS71 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GKN1Q9NS71 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GKN1Q9NS71 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GKN1Q9NS71 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GKN1Q9NS71 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GKN1Q9NS71 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GKN1Q9NS71 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GKN1Q9NS71 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GKN1Q9NS71 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GKN1Q9NS71 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GKN1Q9NS71 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GKN1Q9NS71 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GKN1Q9NS71 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
GKN1Q9NS71 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GKN1Q9NS71 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GKN1Q9NS71 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
GKN1Q9NS71 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GKN1Q9NS71 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GKN1Q9NS71 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GKN1Q9NS71 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GKN1Q9NS71 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GKN1Q9NS71 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GKN1Q9NS71 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
GKN1Q9NS71 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GKN1Q9NS71 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GKN1Q9NS71 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GKN1Q9NS71 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
GKN1Q9NS71 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GKN1Q9NS71 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GKN1Q9NS71 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GKN1Q9NS71 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GKN1Q9NS71 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137 ms