Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS23

RASSF1, Ras association domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF1Q9NS23 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RASSF1Q9NS23 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RASSF1Q9NS23 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RASSF1Q9NS23 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RASSF1Q9NS23 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RASSF1Q9NS23 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RASSF1Q9NS23 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RASSF1Q9NS23 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RASSF1Q9NS23 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RASSF1Q9NS23 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RASSF1Q9NS23 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RASSF1Q9NS23 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RASSF1Q9NS23 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RASSF1Q9NS23 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RASSF1Q9NS23 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RASSF1Q9NS23 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RASSF1Q9NS23 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RASSF1Q9NS23 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RASSF1Q9NS23 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RASSF1Q9NS23 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RASSF1Q9NS23 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RASSF1Q9NS23 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RASSF1Q9NS23 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RASSF1Q9NS23 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RASSF1Q9NS23 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RASSF1Q9NS23 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RASSF1Q9NS23 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RASSF1Q9NS23 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RASSF1Q9NS23 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RASSF1Q9NS23 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RASSF1Q9NS23 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RASSF1Q9NS23 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RASSF1Q9NS23 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RASSF1Q9NS23 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RASSF1Q9NS23 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RASSF1Q9NS23 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RASSF1Q9NS23 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RASSF1Q9NS23 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RASSF1Q9NS23 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RASSF1Q9NS23 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RASSF1Q9NS23 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RASSF1Q9NS23 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RASSF1Q9NS23 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RASSF1Q9NS23 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RASSF1Q9NS23 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RASSF1Q9NS23 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RASSF1Q9NS23 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RASSF1Q9NS23 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RASSF1Q9NS23 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RASSF1Q9NS23 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RASSF1Q9NS23 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RASSF1Q9NS23 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RASSF1Q9NS23 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RASSF1Q9NS23 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RASSF1Q9NS23 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RASSF1Q9NS23 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RASSF1Q9NS23 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RASSF1Q9NS23 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RASSF1Q9NS23 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RASSF1Q9NS23 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RASSF1Q9NS23 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RASSF1Q9NS23 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RASSF1Q9NS23 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RASSF1Q9NS23 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RASSF1Q9NS23 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RASSF1Q9NS23 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RASSF1Q9NS23 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RASSF1Q9NS23 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RASSF1Q9NS23 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RASSF1Q9NS23 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RASSF1Q9NS23 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RASSF1Q9NS23 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RASSF1Q9NS23 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RASSF1Q9NS23 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RASSF1Q9NS23 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RASSF1Q9NS23 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RASSF1Q9NS23 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RASSF1Q9NS23 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RASSF1Q9NS23 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RASSF1Q9NS23 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RASSF1Q9NS23 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RASSF1Q9NS23 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RASSF1Q9NS23 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RASSF1Q9NS23 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RASSF1Q9NS23 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RASSF1Q9NS23 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RASSF1Q9NS23 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RASSF1Q9NS23 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RASSF1Q9NS23 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RASSF1Q9NS23 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RASSF1Q9NS23 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RASSF1Q9NS23 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RASSF1Q9NS23 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RASSF1Q9NS23 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RASSF1Q9NS23 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RASSF1Q9NS23 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RASSF1Q9NS23 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RASSF1Q9NS23 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RASSF1Q9NS23 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RASSF1Q9NS23 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms