Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX3

NDUFA4L2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 4-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA4L2Q9NRX3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NDUFA4L2Q9NRX3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NDUFA4L2Q9NRX3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NDUFA4L2Q9NRX3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NDUFA4L2Q9NRX3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NDUFA4L2Q9NRX3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NDUFA4L2Q9NRX3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NDUFA4L2Q9NRX3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NDUFA4L2Q9NRX3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NDUFA4L2Q9NRX3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NDUFA4L2Q9NRX3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NDUFA4L2Q9NRX3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
NDUFA4L2Q9NRX3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
NDUFA4L2Q9NRX3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NDUFA4L2Q9NRX3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NDUFA4L2Q9NRX3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NDUFA4L2Q9NRX3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NDUFA4L2Q9NRX3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NDUFA4L2Q9NRX3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NDUFA4L2Q9NRX3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NDUFA4L2Q9NRX3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NDUFA4L2Q9NRX3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NDUFA4L2Q9NRX3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NDUFA4L2Q9NRX3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NDUFA4L2Q9NRX3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NDUFA4L2Q9NRX3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NDUFA4L2Q9NRX3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NDUFA4L2Q9NRX3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NDUFA4L2Q9NRX3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NDUFA4L2Q9NRX3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NDUFA4L2Q9NRX3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NDUFA4L2Q9NRX3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NDUFA4L2Q9NRX3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NDUFA4L2Q9NRX3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NDUFA4L2Q9NRX3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NDUFA4L2Q9NRX3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NDUFA4L2Q9NRX3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NDUFA4L2Q9NRX3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NDUFA4L2Q9NRX3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NDUFA4L2Q9NRX3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NDUFA4L2Q9NRX3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NDUFA4L2Q9NRX3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NDUFA4L2Q9NRX3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NDUFA4L2Q9NRX3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NDUFA4L2Q9NRX3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NDUFA4L2Q9NRX3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NDUFA4L2Q9NRX3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDUFA4L2Q9NRX3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDUFA4L2Q9NRX3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDUFA4L2Q9NRX3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDUFA4L2Q9NRX3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NDUFA4L2Q9NRX3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NDUFA4L2Q9NRX3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NDUFA4L2Q9NRX3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NDUFA4L2Q9NRX3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NDUFA4L2Q9NRX3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NDUFA4L2Q9NRX3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NDUFA4L2Q9NRX3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NDUFA4L2Q9NRX3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NDUFA4L2Q9NRX3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NDUFA4L2Q9NRX3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NDUFA4L2Q9NRX3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NDUFA4L2Q9NRX3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NDUFA4L2Q9NRX3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NDUFA4L2Q9NRX3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NDUFA4L2Q9NRX3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NDUFA4L2Q9NRX3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NDUFA4L2Q9NRX3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NDUFA4L2Q9NRX3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NDUFA4L2Q9NRX3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NDUFA4L2Q9NRX3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NDUFA4L2Q9NRX3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NDUFA4L2Q9NRX3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NDUFA4L2Q9NRX3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NDUFA4L2Q9NRX3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NDUFA4L2Q9NRX3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NDUFA4L2Q9NRX3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NDUFA4L2Q9NRX3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NDUFA4L2Q9NRX3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NDUFA4L2Q9NRX3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NDUFA4L2Q9NRX3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NDUFA4L2Q9NRX3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NDUFA4L2Q9NRX3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NDUFA4L2Q9NRX3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NDUFA4L2Q9NRX3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NDUFA4L2Q9NRX3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NDUFA4L2Q9NRX3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NDUFA4L2Q9NRX3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NDUFA4L2Q9NRX3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NDUFA4L2Q9NRX3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NDUFA4L2Q9NRX3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NDUFA4L2Q9NRX3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NDUFA4L2Q9NRX3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NDUFA4L2Q9NRX3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
NDUFA4L2Q9NRX3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NDUFA4L2Q9NRX3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NDUFA4L2Q9NRX3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NDUFA4L2Q9NRX3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NDUFA4L2Q9NRX3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
NDUFA4L2Q9NRX3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms