Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPJ6

MED4, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED4Q9NPJ6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MED4Q9NPJ6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MED4Q9NPJ6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MED4Q9NPJ6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MED4Q9NPJ6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MED4Q9NPJ6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MED4Q9NPJ6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MED4Q9NPJ6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MED4Q9NPJ6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MED4Q9NPJ6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MED4Q9NPJ6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MED4Q9NPJ6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MED4Q9NPJ6 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MED4Q9NPJ6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MED4Q9NPJ6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MED4Q9NPJ6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MED4Q9NPJ6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MED4Q9NPJ6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MED4Q9NPJ6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MED4Q9NPJ6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MED4Q9NPJ6 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MED4Q9NPJ6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MED4Q9NPJ6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MED4Q9NPJ6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MED4Q9NPJ6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MED4Q9NPJ6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MED4Q9NPJ6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MED4Q9NPJ6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MED4Q9NPJ6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MED4Q9NPJ6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MED4Q9NPJ6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MED4Q9NPJ6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MED4Q9NPJ6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MED4Q9NPJ6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MED4Q9NPJ6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MED4Q9NPJ6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MED4Q9NPJ6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MED4Q9NPJ6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MED4Q9NPJ6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MED4Q9NPJ6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MED4Q9NPJ6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MED4Q9NPJ6 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MED4Q9NPJ6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MED4Q9NPJ6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MED4Q9NPJ6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MED4Q9NPJ6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MED4Q9NPJ6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
MED4Q9NPJ6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MED4Q9NPJ6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MED4Q9NPJ6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MED4Q9NPJ6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MED4Q9NPJ6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MED4Q9NPJ6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
MED4Q9NPJ6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
MED4Q9NPJ6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
MED4Q9NPJ6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MED4Q9NPJ6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MED4Q9NPJ6 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MED4Q9NPJ6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MED4Q9NPJ6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MED4Q9NPJ6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MED4Q9NPJ6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MED4Q9NPJ6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MED4Q9NPJ6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MED4Q9NPJ6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MED4Q9NPJ6 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MED4Q9NPJ6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MED4Q9NPJ6 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MED4Q9NPJ6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MED4Q9NPJ6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MED4Q9NPJ6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
MED4Q9NPJ6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MED4Q9NPJ6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MED4Q9NPJ6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MED4Q9NPJ6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MED4Q9NPJ6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MED4Q9NPJ6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MED4Q9NPJ6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MED4Q9NPJ6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MED4Q9NPJ6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MED4Q9NPJ6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MED4Q9NPJ6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MED4Q9NPJ6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MED4Q9NPJ6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MED4Q9NPJ6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MED4Q9NPJ6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MED4Q9NPJ6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MED4Q9NPJ6 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MED4Q9NPJ6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MED4Q9NPJ6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MED4Q9NPJ6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MED4Q9NPJ6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MED4Q9NPJ6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
MED4Q9NPJ6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
MED4Q9NPJ6 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MED4Q9NPJ6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MED4Q9NPJ6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MED4Q9NPJ6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MED4Q9NPJ6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MED4Q9NPJ6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.5 ms