Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI1

BRD7, Bromodomain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD7Q9NPI1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRD7Q9NPI1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRD7Q9NPI1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRD7Q9NPI1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRD7Q9NPI1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRD7Q9NPI1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRD7Q9NPI1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRD7Q9NPI1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRD7Q9NPI1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRD7Q9NPI1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRD7Q9NPI1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRD7Q9NPI1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRD7Q9NPI1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRD7Q9NPI1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRD7Q9NPI1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRD7Q9NPI1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRD7Q9NPI1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRD7Q9NPI1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRD7Q9NPI1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRD7Q9NPI1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRD7Q9NPI1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRD7Q9NPI1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRD7Q9NPI1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRD7Q9NPI1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRD7Q9NPI1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRD7Q9NPI1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
BRD7Q9NPI1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRD7Q9NPI1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRD7Q9NPI1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRD7Q9NPI1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRD7Q9NPI1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRD7Q9NPI1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRD7Q9NPI1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRD7Q9NPI1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRD7Q9NPI1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRD7Q9NPI1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRD7Q9NPI1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRD7Q9NPI1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRD7Q9NPI1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRD7Q9NPI1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRD7Q9NPI1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRD7Q9NPI1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
BRD7Q9NPI1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRD7Q9NPI1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRD7Q9NPI1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRD7Q9NPI1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRD7Q9NPI1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRD7Q9NPI1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRD7Q9NPI1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRD7Q9NPI1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRD7Q9NPI1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRD7Q9NPI1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRD7Q9NPI1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRD7Q9NPI1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRD7Q9NPI1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRD7Q9NPI1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRD7Q9NPI1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRD7Q9NPI1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRD7Q9NPI1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
BRD7Q9NPI1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRD7Q9NPI1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRD7Q9NPI1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRD7Q9NPI1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRD7Q9NPI1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRD7Q9NPI1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRD7Q9NPI1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRD7Q9NPI1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRD7Q9NPI1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRD7Q9NPI1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
BRD7Q9NPI1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRD7Q9NPI1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRD7Q9NPI1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRD7Q9NPI1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRD7Q9NPI1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRD7Q9NPI1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRD7Q9NPI1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRD7Q9NPI1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
BRD7Q9NPI1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BRD7Q9NPI1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
BRD7Q9NPI1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRD7Q9NPI1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRD7Q9NPI1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRD7Q9NPI1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRD7Q9NPI1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRD7Q9NPI1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRD7Q9NPI1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRD7Q9NPI1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRD7Q9NPI1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRD7Q9NPI1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRD7Q9NPI1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BRD7Q9NPI1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
BRD7Q9NPI1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRD7Q9NPI1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRD7Q9NPI1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRD7Q9NPI1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRD7Q9NPI1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRD7Q9NPI1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRD7Q9NPI1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRD7Q9NPI1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BRD7Q9NPI1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms