Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPE2

NGRN, Neugrin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGRNQ9NPE2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NGRNQ9NPE2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NGRNQ9NPE2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NGRNQ9NPE2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
NGRNQ9NPE2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NGRNQ9NPE2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
NGRNQ9NPE2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NGRNQ9NPE2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NGRNQ9NPE2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NGRNQ9NPE2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NGRNQ9NPE2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NGRNQ9NPE2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NGRNQ9NPE2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NGRNQ9NPE2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NGRNQ9NPE2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NGRNQ9NPE2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NGRNQ9NPE2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NGRNQ9NPE2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NGRNQ9NPE2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NGRNQ9NPE2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NGRNQ9NPE2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NGRNQ9NPE2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NGRNQ9NPE2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NGRNQ9NPE2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NGRNQ9NPE2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NGRNQ9NPE2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NGRNQ9NPE2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NGRNQ9NPE2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
NGRNQ9NPE2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NGRNQ9NPE2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
NGRNQ9NPE2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NGRNQ9NPE2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NGRNQ9NPE2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NGRNQ9NPE2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NGRNQ9NPE2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NGRNQ9NPE2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NGRNQ9NPE2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NGRNQ9NPE2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NGRNQ9NPE2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NGRNQ9NPE2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NGRNQ9NPE2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NGRNQ9NPE2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NGRNQ9NPE2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
NGRNQ9NPE2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NGRNQ9NPE2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NGRNQ9NPE2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NGRNQ9NPE2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NGRNQ9NPE2 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NGRNQ9NPE2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NGRNQ9NPE2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NGRNQ9NPE2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
NGRNQ9NPE2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NGRNQ9NPE2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NGRNQ9NPE2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
NGRNQ9NPE2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
NGRNQ9NPE2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NGRNQ9NPE2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NGRNQ9NPE2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NGRNQ9NPE2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NGRNQ9NPE2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NGRNQ9NPE2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NGRNQ9NPE2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NGRNQ9NPE2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NGRNQ9NPE2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NGRNQ9NPE2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NGRNQ9NPE2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
NGRNQ9NPE2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NGRNQ9NPE2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.33■■□□□ 1.96
NGRNQ9NPE2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NGRNQ9NPE2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NGRNQ9NPE2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NGRNQ9NPE2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NGRNQ9NPE2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NGRNQ9NPE2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NGRNQ9NPE2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NGRNQ9NPE2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NGRNQ9NPE2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NGRNQ9NPE2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NGRNQ9NPE2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NGRNQ9NPE2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NGRNQ9NPE2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NGRNQ9NPE2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NGRNQ9NPE2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NGRNQ9NPE2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NGRNQ9NPE2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NGRNQ9NPE2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NGRNQ9NPE2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NGRNQ9NPE2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
NGRNQ9NPE2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NGRNQ9NPE2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NGRNQ9NPE2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NGRNQ9NPE2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NGRNQ9NPE2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NGRNQ9NPE2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NGRNQ9NPE2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
NGRNQ9NPE2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
NGRNQ9NPE2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
NGRNQ9NPE2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NGRNQ9NPE2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NGRNQ9NPE2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms