Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB18Q9NP72 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB18Q9NP72 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB18Q9NP72 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB18Q9NP72 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB18Q9NP72 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB18Q9NP72 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB18Q9NP72 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB18Q9NP72 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB18Q9NP72 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB18Q9NP72 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB18Q9NP72 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB18Q9NP72 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
RAB18Q9NP72 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
RAB18Q9NP72 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB18Q9NP72 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB18Q9NP72 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB18Q9NP72 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB18Q9NP72 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB18Q9NP72 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB18Q9NP72 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB18Q9NP72 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB18Q9NP72 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB18Q9NP72 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB18Q9NP72 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB18Q9NP72 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB18Q9NP72 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB18Q9NP72 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RAB18Q9NP72 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB18Q9NP72 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB18Q9NP72 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB18Q9NP72 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB18Q9NP72 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RAB18Q9NP72 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
RAB18Q9NP72 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB18Q9NP72 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RAB18Q9NP72 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RAB18Q9NP72 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RAB18Q9NP72 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RAB18Q9NP72 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB18Q9NP72 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB18Q9NP72 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB18Q9NP72 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB18Q9NP72 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB18Q9NP72 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB18Q9NP72 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB18Q9NP72 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB18Q9NP72 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB18Q9NP72 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RAB18Q9NP72 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RAB18Q9NP72 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
RAB18Q9NP72 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RAB18Q9NP72 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RAB18Q9NP72 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB18Q9NP72 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB18Q9NP72 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RAB18Q9NP72 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAB18Q9NP72 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAB18Q9NP72 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAB18Q9NP72 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RAB18Q9NP72 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB18Q9NP72 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB18Q9NP72 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB18Q9NP72 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB18Q9NP72 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB18Q9NP72 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB18Q9NP72 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB18Q9NP72 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB18Q9NP72 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB18Q9NP72 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB18Q9NP72 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB18Q9NP72 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB18Q9NP72 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB18Q9NP72 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB18Q9NP72 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB18Q9NP72 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB18Q9NP72 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB18Q9NP72 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB18Q9NP72 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB18Q9NP72 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB18Q9NP72 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB18Q9NP72 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB18Q9NP72 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB18Q9NP72 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB18Q9NP72 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB18Q9NP72 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB18Q9NP72 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB18Q9NP72 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB18Q9NP72 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB18Q9NP72 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB18Q9NP72 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB18Q9NP72 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB18Q9NP72 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB18Q9NP72 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB18Q9NP72 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB18Q9NP72 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB18Q9NP72 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB18Q9NP72 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB18Q9NP72 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB18Q9NP72 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms