Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBV1

POPDC3, Popeye domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POPDC3Q9HBV1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
POPDC3Q9HBV1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
POPDC3Q9HBV1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
POPDC3Q9HBV1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
POPDC3Q9HBV1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
POPDC3Q9HBV1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
POPDC3Q9HBV1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
POPDC3Q9HBV1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
POPDC3Q9HBV1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
POPDC3Q9HBV1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
POPDC3Q9HBV1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
POPDC3Q9HBV1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
POPDC3Q9HBV1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
POPDC3Q9HBV1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
POPDC3Q9HBV1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
POPDC3Q9HBV1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
POPDC3Q9HBV1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
POPDC3Q9HBV1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
POPDC3Q9HBV1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
POPDC3Q9HBV1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
POPDC3Q9HBV1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POPDC3Q9HBV1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
POPDC3Q9HBV1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POPDC3Q9HBV1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POPDC3Q9HBV1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POPDC3Q9HBV1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
POPDC3Q9HBV1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
POPDC3Q9HBV1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
POPDC3Q9HBV1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
POPDC3Q9HBV1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
POPDC3Q9HBV1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
POPDC3Q9HBV1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
POPDC3Q9HBV1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
POPDC3Q9HBV1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POPDC3Q9HBV1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POPDC3Q9HBV1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
POPDC3Q9HBV1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
POPDC3Q9HBV1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
POPDC3Q9HBV1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
POPDC3Q9HBV1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
POPDC3Q9HBV1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
POPDC3Q9HBV1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
POPDC3Q9HBV1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
POPDC3Q9HBV1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
POPDC3Q9HBV1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
POPDC3Q9HBV1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
POPDC3Q9HBV1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
POPDC3Q9HBV1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
POPDC3Q9HBV1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
POPDC3Q9HBV1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
POPDC3Q9HBV1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
POPDC3Q9HBV1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
POPDC3Q9HBV1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
POPDC3Q9HBV1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
POPDC3Q9HBV1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
POPDC3Q9HBV1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
POPDC3Q9HBV1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
POPDC3Q9HBV1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
POPDC3Q9HBV1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
POPDC3Q9HBV1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
POPDC3Q9HBV1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
POPDC3Q9HBV1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
POPDC3Q9HBV1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
POPDC3Q9HBV1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
POPDC3Q9HBV1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
POPDC3Q9HBV1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
POPDC3Q9HBV1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
POPDC3Q9HBV1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
POPDC3Q9HBV1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
POPDC3Q9HBV1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
POPDC3Q9HBV1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
POPDC3Q9HBV1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
POPDC3Q9HBV1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
POPDC3Q9HBV1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
POPDC3Q9HBV1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
POPDC3Q9HBV1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
POPDC3Q9HBV1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
POPDC3Q9HBV1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
POPDC3Q9HBV1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POPDC3Q9HBV1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
POPDC3Q9HBV1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POPDC3Q9HBV1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POPDC3Q9HBV1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POPDC3Q9HBV1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
POPDC3Q9HBV1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
POPDC3Q9HBV1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
POPDC3Q9HBV1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
POPDC3Q9HBV1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
POPDC3Q9HBV1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
POPDC3Q9HBV1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
POPDC3Q9HBV1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
POPDC3Q9HBV1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
POPDC3Q9HBV1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
POPDC3Q9HBV1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
POPDC3Q9HBV1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
POPDC3Q9HBV1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
POPDC3Q9HBV1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
POPDC3Q9HBV1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
POPDC3Q9HBV1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
POPDC3Q9HBV1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 199.6 ms