Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9S5

FKRP, Fukutin-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FKRPQ9H9S5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FKRPQ9H9S5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FKRPQ9H9S5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
FKRPQ9H9S5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FKRPQ9H9S5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FKRPQ9H9S5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FKRPQ9H9S5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FKRPQ9H9S5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FKRPQ9H9S5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FKRPQ9H9S5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FKRPQ9H9S5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FKRPQ9H9S5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FKRPQ9H9S5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FKRPQ9H9S5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FKRPQ9H9S5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FKRPQ9H9S5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FKRPQ9H9S5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FKRPQ9H9S5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FKRPQ9H9S5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FKRPQ9H9S5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FKRPQ9H9S5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FKRPQ9H9S5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FKRPQ9H9S5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FKRPQ9H9S5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FKRPQ9H9S5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
FKRPQ9H9S5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FKRPQ9H9S5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FKRPQ9H9S5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
FKRPQ9H9S5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FKRPQ9H9S5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FKRPQ9H9S5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FKRPQ9H9S5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FKRPQ9H9S5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FKRPQ9H9S5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FKRPQ9H9S5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FKRPQ9H9S5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FKRPQ9H9S5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FKRPQ9H9S5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FKRPQ9H9S5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FKRPQ9H9S5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FKRPQ9H9S5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FKRPQ9H9S5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FKRPQ9H9S5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FKRPQ9H9S5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FKRPQ9H9S5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FKRPQ9H9S5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FKRPQ9H9S5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FKRPQ9H9S5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FKRPQ9H9S5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
FKRPQ9H9S5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FKRPQ9H9S5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FKRPQ9H9S5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FKRPQ9H9S5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FKRPQ9H9S5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FKRPQ9H9S5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FKRPQ9H9S5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FKRPQ9H9S5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FKRPQ9H9S5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FKRPQ9H9S5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FKRPQ9H9S5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FKRPQ9H9S5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FKRPQ9H9S5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FKRPQ9H9S5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FKRPQ9H9S5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FKRPQ9H9S5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FKRPQ9H9S5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
FKRPQ9H9S5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
FKRPQ9H9S5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FKRPQ9H9S5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FKRPQ9H9S5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
FKRPQ9H9S5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FKRPQ9H9S5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FKRPQ9H9S5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FKRPQ9H9S5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FKRPQ9H9S5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FKRPQ9H9S5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FKRPQ9H9S5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FKRPQ9H9S5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FKRPQ9H9S5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FKRPQ9H9S5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FKRPQ9H9S5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FKRPQ9H9S5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FKRPQ9H9S5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FKRPQ9H9S5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FKRPQ9H9S5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FKRPQ9H9S5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FKRPQ9H9S5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FKRPQ9H9S5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FKRPQ9H9S5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FKRPQ9H9S5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FKRPQ9H9S5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FKRPQ9H9S5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FKRPQ9H9S5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FKRPQ9H9S5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FKRPQ9H9S5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FKRPQ9H9S5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
FKRPQ9H9S5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FKRPQ9H9S5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FKRPQ9H9S5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FKRPQ9H9S5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms