Protein–RNA interactions for Protein: Q9H930

SP140L, Nuclear body protein SP140-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140LQ9H930 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SP140LQ9H930 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SP140LQ9H930 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SP140LQ9H930 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SP140LQ9H930 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SP140LQ9H930 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SP140LQ9H930 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SP140LQ9H930 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SP140LQ9H930 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SP140LQ9H930 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SP140LQ9H930 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SP140LQ9H930 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SP140LQ9H930 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SP140LQ9H930 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SP140LQ9H930 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SP140LQ9H930 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SP140LQ9H930 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SP140LQ9H930 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SP140LQ9H930 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SP140LQ9H930 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SP140LQ9H930 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SP140LQ9H930 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SP140LQ9H930 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SP140LQ9H930 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SP140LQ9H930 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SP140LQ9H930 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SP140LQ9H930 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SP140LQ9H930 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SP140LQ9H930 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SP140LQ9H930 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SP140LQ9H930 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SP140LQ9H930 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SP140LQ9H930 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SP140LQ9H930 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SP140LQ9H930 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SP140LQ9H930 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SP140LQ9H930 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SP140LQ9H930 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SP140LQ9H930 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SP140LQ9H930 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SP140LQ9H930 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SP140LQ9H930 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SP140LQ9H930 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SP140LQ9H930 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SP140LQ9H930 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SP140LQ9H930 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SP140LQ9H930 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SP140LQ9H930 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SP140LQ9H930 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SP140LQ9H930 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SP140LQ9H930 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SP140LQ9H930 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SP140LQ9H930 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SP140LQ9H930 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SP140LQ9H930 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SP140LQ9H930 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SP140LQ9H930 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SP140LQ9H930 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SP140LQ9H930 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SP140LQ9H930 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SP140LQ9H930 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SP140LQ9H930 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SP140LQ9H930 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SP140LQ9H930 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SP140LQ9H930 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SP140LQ9H930 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SP140LQ9H930 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SP140LQ9H930 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SP140LQ9H930 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SP140LQ9H930 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SP140LQ9H930 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SP140LQ9H930 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SP140LQ9H930 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SP140LQ9H930 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SP140LQ9H930 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SP140LQ9H930 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SP140LQ9H930 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SP140LQ9H930 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SP140LQ9H930 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SP140LQ9H930 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SP140LQ9H930 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SP140LQ9H930 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SP140LQ9H930 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SP140LQ9H930 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SP140LQ9H930 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SP140LQ9H930 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SP140LQ9H930 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SP140LQ9H930 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SP140LQ9H930 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SP140LQ9H930 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SP140LQ9H930 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SP140LQ9H930 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SP140LQ9H930 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SP140LQ9H930 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SP140LQ9H930 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SP140LQ9H930 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SP140LQ9H930 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SP140LQ9H930 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SP140LQ9H930 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SP140LQ9H930 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms