Protein–RNA interactions for Protein: Q9H875

PRKRIP1, PRKR-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKRIP1Q9H875 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
PRKRIP1Q9H875 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
PRKRIP1Q9H875 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
PRKRIP1Q9H875 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
PRKRIP1Q9H875 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
PRKRIP1Q9H875 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
PRKRIP1Q9H875 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
PRKRIP1Q9H875 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
PRKRIP1Q9H875 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
PRKRIP1Q9H875 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
PRKRIP1Q9H875 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
PRKRIP1Q9H875 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
PRKRIP1Q9H875 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
PRKRIP1Q9H875 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
PRKRIP1Q9H875 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
PRKRIP1Q9H875 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
PRKRIP1Q9H875 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
PRKRIP1Q9H875 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
PRKRIP1Q9H875 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
PRKRIP1Q9H875 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC34.67■■■■□ 3.14
PRKRIP1Q9H875 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
PRKRIP1Q9H875 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
PRKRIP1Q9H875 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
PRKRIP1Q9H875 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
PRKRIP1Q9H875 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
PRKRIP1Q9H875 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
PRKRIP1Q9H875 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
PRKRIP1Q9H875 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
PRKRIP1Q9H875 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
PRKRIP1Q9H875 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC34.64■■■■□ 3.14
PRKRIP1Q9H875 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
PRKRIP1Q9H875 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
PRKRIP1Q9H875 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
PRKRIP1Q9H875 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
PRKRIP1Q9H875 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
PRKRIP1Q9H875 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
PRKRIP1Q9H875 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
PRKRIP1Q9H875 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
PRKRIP1Q9H875 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
PRKRIP1Q9H875 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
PRKRIP1Q9H875 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
PRKRIP1Q9H875 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
PRKRIP1Q9H875 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
PRKRIP1Q9H875 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
PRKRIP1Q9H875 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
PRKRIP1Q9H875 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
PRKRIP1Q9H875 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
PRKRIP1Q9H875 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
PRKRIP1Q9H875 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
PRKRIP1Q9H875 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
PRKRIP1Q9H875 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
PRKRIP1Q9H875 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
PRKRIP1Q9H875 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
PRKRIP1Q9H875 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
PRKRIP1Q9H875 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
PRKRIP1Q9H875 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
PRKRIP1Q9H875 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
PRKRIP1Q9H875 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
PRKRIP1Q9H875 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
PRKRIP1Q9H875 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
PRKRIP1Q9H875 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
PRKRIP1Q9H875 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
PRKRIP1Q9H875 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
PRKRIP1Q9H875 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
PRKRIP1Q9H875 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
PRKRIP1Q9H875 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
PRKRIP1Q9H875 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC34.52■■■■□ 3.12
PRKRIP1Q9H875 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
PRKRIP1Q9H875 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
PRKRIP1Q9H875 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
PRKRIP1Q9H875 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC34.51■■■■□ 3.12
PRKRIP1Q9H875 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
PRKRIP1Q9H875 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
PRKRIP1Q9H875 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
PRKRIP1Q9H875 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
PRKRIP1Q9H875 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
PRKRIP1Q9H875 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
PRKRIP1Q9H875 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
PRKRIP1Q9H875 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
PRKRIP1Q9H875 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
PRKRIP1Q9H875 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
PRKRIP1Q9H875 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
PRKRIP1Q9H875 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
PRKRIP1Q9H875 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
PRKRIP1Q9H875 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
PRKRIP1Q9H875 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
PRKRIP1Q9H875 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
PRKRIP1Q9H875 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
PRKRIP1Q9H875 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
PRKRIP1Q9H875 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
PRKRIP1Q9H875 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC34.45■■■■□ 3.11
PRKRIP1Q9H875 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC34.45■■■■□ 3.11
PRKRIP1Q9H875 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
PRKRIP1Q9H875 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
PRKRIP1Q9H875 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
PRKRIP1Q9H875 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
PRKRIP1Q9H875 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
PRKRIP1Q9H875 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
PRKRIP1Q9H875 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
PRKRIP1Q9H875 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms