Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NRDE2Q9H7Z3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NRDE2Q9H7Z3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NRDE2Q9H7Z3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NRDE2Q9H7Z3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NRDE2Q9H7Z3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NRDE2Q9H7Z3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NRDE2Q9H7Z3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2
NRDE2Q9H7Z3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
NRDE2Q9H7Z3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NRDE2Q9H7Z3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NRDE2Q9H7Z3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NRDE2Q9H7Z3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NRDE2Q9H7Z3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NRDE2Q9H7Z3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NRDE2Q9H7Z3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NRDE2Q9H7Z3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NRDE2Q9H7Z3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.55■■■□□ 2
NRDE2Q9H7Z3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NRDE2Q9H7Z3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NRDE2Q9H7Z3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NRDE2Q9H7Z3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
NRDE2Q9H7Z3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NRDE2Q9H7Z3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
NRDE2Q9H7Z3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NRDE2Q9H7Z3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NRDE2Q9H7Z3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NRDE2Q9H7Z3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NRDE2Q9H7Z3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.53■■■□□ 2
NRDE2Q9H7Z3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NRDE2Q9H7Z3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
NRDE2Q9H7Z3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NRDE2Q9H7Z3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NRDE2Q9H7Z3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NRDE2Q9H7Z3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NRDE2Q9H7Z3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NRDE2Q9H7Z3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
NRDE2Q9H7Z3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NRDE2Q9H7Z3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NRDE2Q9H7Z3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NRDE2Q9H7Z3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NRDE2Q9H7Z3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NRDE2Q9H7Z3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NRDE2Q9H7Z3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NRDE2Q9H7Z3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NRDE2Q9H7Z3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NRDE2Q9H7Z3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NRDE2Q9H7Z3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NRDE2Q9H7Z3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NRDE2Q9H7Z3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NRDE2Q9H7Z3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NRDE2Q9H7Z3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
NRDE2Q9H7Z3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NRDE2Q9H7Z3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NRDE2Q9H7Z3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NRDE2Q9H7Z3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NRDE2Q9H7Z3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NRDE2Q9H7Z3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
NRDE2Q9H7Z3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NRDE2Q9H7Z3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NRDE2Q9H7Z3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NRDE2Q9H7Z3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NRDE2Q9H7Z3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NRDE2Q9H7Z3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
NRDE2Q9H7Z3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NRDE2Q9H7Z3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NRDE2Q9H7Z3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NRDE2Q9H7Z3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NRDE2Q9H7Z3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NRDE2Q9H7Z3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NRDE2Q9H7Z3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NRDE2Q9H7Z3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NRDE2Q9H7Z3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NRDE2Q9H7Z3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NRDE2Q9H7Z3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NRDE2Q9H7Z3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NRDE2Q9H7Z3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NRDE2Q9H7Z3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NRDE2Q9H7Z3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NRDE2Q9H7Z3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NRDE2Q9H7Z3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NRDE2Q9H7Z3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NRDE2Q9H7Z3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NRDE2Q9H7Z3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NRDE2Q9H7Z3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NRDE2Q9H7Z3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NRDE2Q9H7Z3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NRDE2Q9H7Z3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NRDE2Q9H7Z3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NRDE2Q9H7Z3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NRDE2Q9H7Z3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NRDE2Q9H7Z3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NRDE2Q9H7Z3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NRDE2Q9H7Z3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NRDE2Q9H7Z3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NRDE2Q9H7Z3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NRDE2Q9H7Z3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
NRDE2Q9H7Z3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NRDE2Q9H7Z3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NRDE2Q9H7Z3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms