Protein–RNA interactions for Protein: Q9H611

PIF1, ATP-dependent DNA helicase PIF1, humanhuman

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIF1Q9H611 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PIF1Q9H611 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PIF1Q9H611 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PIF1Q9H611 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PIF1Q9H611 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PIF1Q9H611 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PIF1Q9H611 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PIF1Q9H611 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PIF1Q9H611 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PIF1Q9H611 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PIF1Q9H611 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PIF1Q9H611 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PIF1Q9H611 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PIF1Q9H611 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PIF1Q9H611 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PIF1Q9H611 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PIF1Q9H611 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PIF1Q9H611 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PIF1Q9H611 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PIF1Q9H611 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PIF1Q9H611 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PIF1Q9H611 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PIF1Q9H611 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PIF1Q9H611 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PIF1Q9H611 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PIF1Q9H611 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PIF1Q9H611 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PIF1Q9H611 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PIF1Q9H611 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PIF1Q9H611 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PIF1Q9H611 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PIF1Q9H611 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PIF1Q9H611 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PIF1Q9H611 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PIF1Q9H611 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PIF1Q9H611 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PIF1Q9H611 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PIF1Q9H611 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PIF1Q9H611 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PIF1Q9H611 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PIF1Q9H611 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PIF1Q9H611 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PIF1Q9H611 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PIF1Q9H611 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PIF1Q9H611 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PIF1Q9H611 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PIF1Q9H611 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PIF1Q9H611 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PIF1Q9H611 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PIF1Q9H611 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PIF1Q9H611 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PIF1Q9H611 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PIF1Q9H611 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PIF1Q9H611 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PIF1Q9H611 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PIF1Q9H611 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PIF1Q9H611 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PIF1Q9H611 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PIF1Q9H611 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PIF1Q9H611 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PIF1Q9H611 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PIF1Q9H611 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PIF1Q9H611 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PIF1Q9H611 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PIF1Q9H611 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PIF1Q9H611 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PIF1Q9H611 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PIF1Q9H611 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PIF1Q9H611 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PIF1Q9H611 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PIF1Q9H611 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PIF1Q9H611 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PIF1Q9H611 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PIF1Q9H611 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PIF1Q9H611 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PIF1Q9H611 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PIF1Q9H611 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PIF1Q9H611 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PIF1Q9H611 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PIF1Q9H611 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PIF1Q9H611 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PIF1Q9H611 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PIF1Q9H611 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PIF1Q9H611 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PIF1Q9H611 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PIF1Q9H611 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PIF1Q9H611 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PIF1Q9H611 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PIF1Q9H611 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PIF1Q9H611 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PIF1Q9H611 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PIF1Q9H611 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PIF1Q9H611 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PIF1Q9H611 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PIF1Q9H611 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PIF1Q9H611 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PIF1Q9H611 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PIF1Q9H611 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PIF1Q9H611 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PIF1Q9H611 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms