Protein–RNA interactions for Protein: Q9H5U6

ZCCHC4, Zinc finger CCHC domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC4Q9H5U6 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ZCCHC4Q9H5U6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZCCHC4Q9H5U6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZCCHC4Q9H5U6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZCCHC4Q9H5U6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZCCHC4Q9H5U6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZCCHC4Q9H5U6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZCCHC4Q9H5U6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZCCHC4Q9H5U6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZCCHC4Q9H5U6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZCCHC4Q9H5U6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZCCHC4Q9H5U6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZCCHC4Q9H5U6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZCCHC4Q9H5U6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZCCHC4Q9H5U6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZCCHC4Q9H5U6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZCCHC4Q9H5U6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZCCHC4Q9H5U6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ZCCHC4Q9H5U6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZCCHC4Q9H5U6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZCCHC4Q9H5U6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZCCHC4Q9H5U6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZCCHC4Q9H5U6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZCCHC4Q9H5U6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZCCHC4Q9H5U6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZCCHC4Q9H5U6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZCCHC4Q9H5U6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZCCHC4Q9H5U6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZCCHC4Q9H5U6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZCCHC4Q9H5U6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ZCCHC4Q9H5U6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZCCHC4Q9H5U6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZCCHC4Q9H5U6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZCCHC4Q9H5U6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZCCHC4Q9H5U6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZCCHC4Q9H5U6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZCCHC4Q9H5U6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZCCHC4Q9H5U6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZCCHC4Q9H5U6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZCCHC4Q9H5U6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZCCHC4Q9H5U6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZCCHC4Q9H5U6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZCCHC4Q9H5U6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZCCHC4Q9H5U6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZCCHC4Q9H5U6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZCCHC4Q9H5U6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZCCHC4Q9H5U6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZCCHC4Q9H5U6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZCCHC4Q9H5U6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZCCHC4Q9H5U6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZCCHC4Q9H5U6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZCCHC4Q9H5U6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZCCHC4Q9H5U6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZCCHC4Q9H5U6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZCCHC4Q9H5U6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZCCHC4Q9H5U6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZCCHC4Q9H5U6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZCCHC4Q9H5U6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZCCHC4Q9H5U6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZCCHC4Q9H5U6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZCCHC4Q9H5U6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ZCCHC4Q9H5U6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZCCHC4Q9H5U6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZCCHC4Q9H5U6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZCCHC4Q9H5U6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZCCHC4Q9H5U6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZCCHC4Q9H5U6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZCCHC4Q9H5U6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZCCHC4Q9H5U6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZCCHC4Q9H5U6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
ZCCHC4Q9H5U6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZCCHC4Q9H5U6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZCCHC4Q9H5U6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZCCHC4Q9H5U6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZCCHC4Q9H5U6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZCCHC4Q9H5U6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZCCHC4Q9H5U6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZCCHC4Q9H5U6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZCCHC4Q9H5U6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZCCHC4Q9H5U6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ZCCHC4Q9H5U6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZCCHC4Q9H5U6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZCCHC4Q9H5U6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZCCHC4Q9H5U6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZCCHC4Q9H5U6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZCCHC4Q9H5U6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZCCHC4Q9H5U6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZCCHC4Q9H5U6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZCCHC4Q9H5U6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZCCHC4Q9H5U6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZCCHC4Q9H5U6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZCCHC4Q9H5U6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZCCHC4Q9H5U6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZCCHC4Q9H5U6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZCCHC4Q9H5U6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZCCHC4Q9H5U6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ZCCHC4Q9H5U6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ZCCHC4Q9H5U6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ZCCHC4Q9H5U6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZCCHC4Q9H5U6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms