Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ71

PITPNM3, Membrane-associated phosphatidylinositol transfer protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 974 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNM3Q9BZ71 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PITPNM3Q9BZ71 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PITPNM3Q9BZ71 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PITPNM3Q9BZ71 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PITPNM3Q9BZ71 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PITPNM3Q9BZ71 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PITPNM3Q9BZ71 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PITPNM3Q9BZ71 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PITPNM3Q9BZ71 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PITPNM3Q9BZ71 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PITPNM3Q9BZ71 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PITPNM3Q9BZ71 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PITPNM3Q9BZ71 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PITPNM3Q9BZ71 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PITPNM3Q9BZ71 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PITPNM3Q9BZ71 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PITPNM3Q9BZ71 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PITPNM3Q9BZ71 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PITPNM3Q9BZ71 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PITPNM3Q9BZ71 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PITPNM3Q9BZ71 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PITPNM3Q9BZ71 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PITPNM3Q9BZ71 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PITPNM3Q9BZ71 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PITPNM3Q9BZ71 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PITPNM3Q9BZ71 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PITPNM3Q9BZ71 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PITPNM3Q9BZ71 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PITPNM3Q9BZ71 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PITPNM3Q9BZ71 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PITPNM3Q9BZ71 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PITPNM3Q9BZ71 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PITPNM3Q9BZ71 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PITPNM3Q9BZ71 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PITPNM3Q9BZ71 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PITPNM3Q9BZ71 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PITPNM3Q9BZ71 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PITPNM3Q9BZ71 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PITPNM3Q9BZ71 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PITPNM3Q9BZ71 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PITPNM3Q9BZ71 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PITPNM3Q9BZ71 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PITPNM3Q9BZ71 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PITPNM3Q9BZ71 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PITPNM3Q9BZ71 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PITPNM3Q9BZ71 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PITPNM3Q9BZ71 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PITPNM3Q9BZ71 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PITPNM3Q9BZ71 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PITPNM3Q9BZ71 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PITPNM3Q9BZ71 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PITPNM3Q9BZ71 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PITPNM3Q9BZ71 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PITPNM3Q9BZ71 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PITPNM3Q9BZ71 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PITPNM3Q9BZ71 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PITPNM3Q9BZ71 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PITPNM3Q9BZ71 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PITPNM3Q9BZ71 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PITPNM3Q9BZ71 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PITPNM3Q9BZ71 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PITPNM3Q9BZ71 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PITPNM3Q9BZ71 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PITPNM3Q9BZ71 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PITPNM3Q9BZ71 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PITPNM3Q9BZ71 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PITPNM3Q9BZ71 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PITPNM3Q9BZ71 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PITPNM3Q9BZ71 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PITPNM3Q9BZ71 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PITPNM3Q9BZ71 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PITPNM3Q9BZ71 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PITPNM3Q9BZ71 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PITPNM3Q9BZ71 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PITPNM3Q9BZ71 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PITPNM3Q9BZ71 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PITPNM3Q9BZ71 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PITPNM3Q9BZ71 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PITPNM3Q9BZ71 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PITPNM3Q9BZ71 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PITPNM3Q9BZ71 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PITPNM3Q9BZ71 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PITPNM3Q9BZ71 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PITPNM3Q9BZ71 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PITPNM3Q9BZ71 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PITPNM3Q9BZ71 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PITPNM3Q9BZ71 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PITPNM3Q9BZ71 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PITPNM3Q9BZ71 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PITPNM3Q9BZ71 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PITPNM3Q9BZ71 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PITPNM3Q9BZ71 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PITPNM3Q9BZ71 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PITPNM3Q9BZ71 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PITPNM3Q9BZ71 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PITPNM3Q9BZ71 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PITPNM3Q9BZ71 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PITPNM3Q9BZ71 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PITPNM3Q9BZ71 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PITPNM3Q9BZ71 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.2 ms