Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM55Q9BYV6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM55Q9BYV6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRIM55Q9BYV6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRIM55Q9BYV6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM55Q9BYV6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM55Q9BYV6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM55Q9BYV6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM55Q9BYV6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM55Q9BYV6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM55Q9BYV6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM55Q9BYV6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM55Q9BYV6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM55Q9BYV6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM55Q9BYV6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM55Q9BYV6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM55Q9BYV6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM55Q9BYV6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM55Q9BYV6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM55Q9BYV6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM55Q9BYV6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM55Q9BYV6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
TRIM55Q9BYV6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM55Q9BYV6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM55Q9BYV6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM55Q9BYV6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM55Q9BYV6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM55Q9BYV6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM55Q9BYV6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM55Q9BYV6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM55Q9BYV6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM55Q9BYV6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM55Q9BYV6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM55Q9BYV6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM55Q9BYV6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM55Q9BYV6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM55Q9BYV6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM55Q9BYV6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM55Q9BYV6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM55Q9BYV6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM55Q9BYV6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM55Q9BYV6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM55Q9BYV6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM55Q9BYV6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM55Q9BYV6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM55Q9BYV6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM55Q9BYV6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM55Q9BYV6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM55Q9BYV6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM55Q9BYV6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM55Q9BYV6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM55Q9BYV6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM55Q9BYV6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM55Q9BYV6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM55Q9BYV6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM55Q9BYV6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM55Q9BYV6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM55Q9BYV6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM55Q9BYV6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM55Q9BYV6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM55Q9BYV6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM55Q9BYV6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM55Q9BYV6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM55Q9BYV6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM55Q9BYV6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM55Q9BYV6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM55Q9BYV6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM55Q9BYV6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM55Q9BYV6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM55Q9BYV6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM55Q9BYV6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM55Q9BYV6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM55Q9BYV6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM55Q9BYV6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM55Q9BYV6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM55Q9BYV6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM55Q9BYV6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM55Q9BYV6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM55Q9BYV6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM55Q9BYV6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM55Q9BYV6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM55Q9BYV6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM55Q9BYV6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM55Q9BYV6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TRIM55Q9BYV6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TRIM55Q9BYV6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM55Q9BYV6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM55Q9BYV6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM55Q9BYV6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM55Q9BYV6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM55Q9BYV6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM55Q9BYV6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM55Q9BYV6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM55Q9BYV6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM55Q9BYV6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM55Q9BYV6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM55Q9BYV6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM55Q9BYV6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM55Q9BYV6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM55Q9BYV6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms