Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY4

RSPO3, R-spondin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO3Q9BXY4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RSPO3Q9BXY4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RSPO3Q9BXY4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RSPO3Q9BXY4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RSPO3Q9BXY4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RSPO3Q9BXY4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RSPO3Q9BXY4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RSPO3Q9BXY4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RSPO3Q9BXY4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RSPO3Q9BXY4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RSPO3Q9BXY4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RSPO3Q9BXY4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RSPO3Q9BXY4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RSPO3Q9BXY4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RSPO3Q9BXY4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RSPO3Q9BXY4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RSPO3Q9BXY4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RSPO3Q9BXY4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RSPO3Q9BXY4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RSPO3Q9BXY4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RSPO3Q9BXY4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RSPO3Q9BXY4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RSPO3Q9BXY4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RSPO3Q9BXY4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RSPO3Q9BXY4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RSPO3Q9BXY4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RSPO3Q9BXY4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RSPO3Q9BXY4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RSPO3Q9BXY4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RSPO3Q9BXY4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RSPO3Q9BXY4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RSPO3Q9BXY4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RSPO3Q9BXY4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RSPO3Q9BXY4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RSPO3Q9BXY4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RSPO3Q9BXY4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RSPO3Q9BXY4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RSPO3Q9BXY4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RSPO3Q9BXY4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RSPO3Q9BXY4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RSPO3Q9BXY4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RSPO3Q9BXY4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RSPO3Q9BXY4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RSPO3Q9BXY4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RSPO3Q9BXY4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RSPO3Q9BXY4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RSPO3Q9BXY4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RSPO3Q9BXY4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RSPO3Q9BXY4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RSPO3Q9BXY4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RSPO3Q9BXY4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RSPO3Q9BXY4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RSPO3Q9BXY4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RSPO3Q9BXY4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RSPO3Q9BXY4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RSPO3Q9BXY4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RSPO3Q9BXY4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RSPO3Q9BXY4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RSPO3Q9BXY4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RSPO3Q9BXY4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RSPO3Q9BXY4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RSPO3Q9BXY4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RSPO3Q9BXY4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RSPO3Q9BXY4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RSPO3Q9BXY4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RSPO3Q9BXY4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RSPO3Q9BXY4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RSPO3Q9BXY4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RSPO3Q9BXY4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RSPO3Q9BXY4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RSPO3Q9BXY4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RSPO3Q9BXY4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RSPO3Q9BXY4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RSPO3Q9BXY4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RSPO3Q9BXY4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RSPO3Q9BXY4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RSPO3Q9BXY4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RSPO3Q9BXY4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RSPO3Q9BXY4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RSPO3Q9BXY4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RSPO3Q9BXY4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RSPO3Q9BXY4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RSPO3Q9BXY4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RSPO3Q9BXY4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RSPO3Q9BXY4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RSPO3Q9BXY4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RSPO3Q9BXY4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RSPO3Q9BXY4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RSPO3Q9BXY4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RSPO3Q9BXY4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RSPO3Q9BXY4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RSPO3Q9BXY4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RSPO3Q9BXY4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RSPO3Q9BXY4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RSPO3Q9BXY4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RSPO3Q9BXY4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RSPO3Q9BXY4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RSPO3Q9BXY4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RSPO3Q9BXY4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RSPO3Q9BXY4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.4 ms