Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV44

THUMPD3, THUMP domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD3Q9BV44 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
THUMPD3Q9BV44 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
THUMPD3Q9BV44 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
THUMPD3Q9BV44 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
THUMPD3Q9BV44 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
THUMPD3Q9BV44 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
THUMPD3Q9BV44 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
THUMPD3Q9BV44 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
THUMPD3Q9BV44 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
THUMPD3Q9BV44 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
THUMPD3Q9BV44 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
THUMPD3Q9BV44 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
THUMPD3Q9BV44 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
THUMPD3Q9BV44 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
THUMPD3Q9BV44 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
THUMPD3Q9BV44 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
THUMPD3Q9BV44 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
THUMPD3Q9BV44 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
THUMPD3Q9BV44 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
THUMPD3Q9BV44 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
THUMPD3Q9BV44 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
THUMPD3Q9BV44 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
THUMPD3Q9BV44 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
THUMPD3Q9BV44 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
THUMPD3Q9BV44 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
THUMPD3Q9BV44 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
THUMPD3Q9BV44 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
THUMPD3Q9BV44 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
THUMPD3Q9BV44 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
THUMPD3Q9BV44 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
THUMPD3Q9BV44 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
THUMPD3Q9BV44 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
THUMPD3Q9BV44 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
THUMPD3Q9BV44 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
THUMPD3Q9BV44 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
THUMPD3Q9BV44 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
THUMPD3Q9BV44 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
THUMPD3Q9BV44 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
THUMPD3Q9BV44 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
THUMPD3Q9BV44 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
THUMPD3Q9BV44 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
THUMPD3Q9BV44 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
THUMPD3Q9BV44 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
THUMPD3Q9BV44 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
THUMPD3Q9BV44 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
THUMPD3Q9BV44 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
THUMPD3Q9BV44 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
THUMPD3Q9BV44 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
THUMPD3Q9BV44 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
THUMPD3Q9BV44 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24■■□□□ 1.43
THUMPD3Q9BV44 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
THUMPD3Q9BV44 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
THUMPD3Q9BV44 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
THUMPD3Q9BV44 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
THUMPD3Q9BV44 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
THUMPD3Q9BV44 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
THUMPD3Q9BV44 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
THUMPD3Q9BV44 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
THUMPD3Q9BV44 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
THUMPD3Q9BV44 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
THUMPD3Q9BV44 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
THUMPD3Q9BV44 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
THUMPD3Q9BV44 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
THUMPD3Q9BV44 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
THUMPD3Q9BV44 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
THUMPD3Q9BV44 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
THUMPD3Q9BV44 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
THUMPD3Q9BV44 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
THUMPD3Q9BV44 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
THUMPD3Q9BV44 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
THUMPD3Q9BV44 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
THUMPD3Q9BV44 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
THUMPD3Q9BV44 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
THUMPD3Q9BV44 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
THUMPD3Q9BV44 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
THUMPD3Q9BV44 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
THUMPD3Q9BV44 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
THUMPD3Q9BV44 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
THUMPD3Q9BV44 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
THUMPD3Q9BV44 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
THUMPD3Q9BV44 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
THUMPD3Q9BV44 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
THUMPD3Q9BV44 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
THUMPD3Q9BV44 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
THUMPD3Q9BV44 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
THUMPD3Q9BV44 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
THUMPD3Q9BV44 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
THUMPD3Q9BV44 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
THUMPD3Q9BV44 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
THUMPD3Q9BV44 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
THUMPD3Q9BV44 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
THUMPD3Q9BV44 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
THUMPD3Q9BV44 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
THUMPD3Q9BV44 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
THUMPD3Q9BV44 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
THUMPD3Q9BV44 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
THUMPD3Q9BV44 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
THUMPD3Q9BV44 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
THUMPD3Q9BV44 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
THUMPD3Q9BV44 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms