Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV29

CCDC32, Coiled-coil domain-containing protein 32, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC32Q9BV29 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC32Q9BV29 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC32Q9BV29 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCDC32Q9BV29 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC32Q9BV29 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC32Q9BV29 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC32Q9BV29 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC32Q9BV29 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC32Q9BV29 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC32Q9BV29 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC32Q9BV29 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC32Q9BV29 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC32Q9BV29 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC32Q9BV29 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC32Q9BV29 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC32Q9BV29 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC32Q9BV29 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC32Q9BV29 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC32Q9BV29 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC32Q9BV29 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC32Q9BV29 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC32Q9BV29 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC32Q9BV29 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC32Q9BV29 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC32Q9BV29 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC32Q9BV29 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC32Q9BV29 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC32Q9BV29 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC32Q9BV29 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC32Q9BV29 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC32Q9BV29 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC32Q9BV29 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC32Q9BV29 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC32Q9BV29 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC32Q9BV29 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC32Q9BV29 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC32Q9BV29 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC32Q9BV29 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC32Q9BV29 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC32Q9BV29 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC32Q9BV29 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC32Q9BV29 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC32Q9BV29 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC32Q9BV29 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC32Q9BV29 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC32Q9BV29 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC32Q9BV29 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC32Q9BV29 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC32Q9BV29 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC32Q9BV29 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC32Q9BV29 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC32Q9BV29 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC32Q9BV29 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC32Q9BV29 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC32Q9BV29 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC32Q9BV29 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC32Q9BV29 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC32Q9BV29 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC32Q9BV29 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC32Q9BV29 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC32Q9BV29 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC32Q9BV29 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC32Q9BV29 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC32Q9BV29 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC32Q9BV29 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC32Q9BV29 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC32Q9BV29 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC32Q9BV29 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC32Q9BV29 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC32Q9BV29 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC32Q9BV29 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC32Q9BV29 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC32Q9BV29 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC32Q9BV29 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC32Q9BV29 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC32Q9BV29 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC32Q9BV29 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC32Q9BV29 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC32Q9BV29 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC32Q9BV29 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC32Q9BV29 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC32Q9BV29 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC32Q9BV29 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC32Q9BV29 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC32Q9BV29 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC32Q9BV29 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC32Q9BV29 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC32Q9BV29 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC32Q9BV29 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC32Q9BV29 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC32Q9BV29 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC32Q9BV29 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC32Q9BV29 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC32Q9BV29 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC32Q9BV29 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC32Q9BV29 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC32Q9BV29 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC32Q9BV29 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC32Q9BV29 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC32Q9BV29 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms