Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUF5

TUBB6, Tubulin beta-6 chain, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB6Q9BUF5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TUBB6Q9BUF5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TUBB6Q9BUF5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TUBB6Q9BUF5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TUBB6Q9BUF5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TUBB6Q9BUF5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TUBB6Q9BUF5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TUBB6Q9BUF5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TUBB6Q9BUF5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TUBB6Q9BUF5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TUBB6Q9BUF5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TUBB6Q9BUF5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TUBB6Q9BUF5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TUBB6Q9BUF5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TUBB6Q9BUF5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TUBB6Q9BUF5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TUBB6Q9BUF5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TUBB6Q9BUF5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TUBB6Q9BUF5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TUBB6Q9BUF5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TUBB6Q9BUF5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TUBB6Q9BUF5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TUBB6Q9BUF5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TUBB6Q9BUF5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TUBB6Q9BUF5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TUBB6Q9BUF5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TUBB6Q9BUF5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TUBB6Q9BUF5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TUBB6Q9BUF5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TUBB6Q9BUF5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TUBB6Q9BUF5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TUBB6Q9BUF5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TUBB6Q9BUF5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TUBB6Q9BUF5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TUBB6Q9BUF5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TUBB6Q9BUF5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TUBB6Q9BUF5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TUBB6Q9BUF5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TUBB6Q9BUF5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TUBB6Q9BUF5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TUBB6Q9BUF5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TUBB6Q9BUF5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TUBB6Q9BUF5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TUBB6Q9BUF5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TUBB6Q9BUF5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TUBB6Q9BUF5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TUBB6Q9BUF5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TUBB6Q9BUF5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TUBB6Q9BUF5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TUBB6Q9BUF5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TUBB6Q9BUF5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TUBB6Q9BUF5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TUBB6Q9BUF5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TUBB6Q9BUF5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TUBB6Q9BUF5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TUBB6Q9BUF5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TUBB6Q9BUF5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TUBB6Q9BUF5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TUBB6Q9BUF5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TUBB6Q9BUF5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TUBB6Q9BUF5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TUBB6Q9BUF5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TUBB6Q9BUF5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TUBB6Q9BUF5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TUBB6Q9BUF5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TUBB6Q9BUF5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TUBB6Q9BUF5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TUBB6Q9BUF5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TUBB6Q9BUF5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TUBB6Q9BUF5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TUBB6Q9BUF5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TUBB6Q9BUF5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TUBB6Q9BUF5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TUBB6Q9BUF5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TUBB6Q9BUF5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TUBB6Q9BUF5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TUBB6Q9BUF5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TUBB6Q9BUF5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TUBB6Q9BUF5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TUBB6Q9BUF5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TUBB6Q9BUF5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TUBB6Q9BUF5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TUBB6Q9BUF5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TUBB6Q9BUF5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TUBB6Q9BUF5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TUBB6Q9BUF5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TUBB6Q9BUF5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TUBB6Q9BUF5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TUBB6Q9BUF5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TUBB6Q9BUF5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TUBB6Q9BUF5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TUBB6Q9BUF5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TUBB6Q9BUF5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TUBB6Q9BUF5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TUBB6Q9BUF5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TUBB6Q9BUF5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TUBB6Q9BUF5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TUBB6Q9BUF5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TUBB6Q9BUF5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TUBB6Q9BUF5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms