Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU64

CENPO, Centromere protein O, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPOQ9BU64 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPOQ9BU64 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CENPOQ9BU64 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CENPOQ9BU64 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CENPOQ9BU64 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CENPOQ9BU64 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CENPOQ9BU64 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CENPOQ9BU64 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CENPOQ9BU64 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPOQ9BU64 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPOQ9BU64 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPOQ9BU64 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPOQ9BU64 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPOQ9BU64 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPOQ9BU64 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPOQ9BU64 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPOQ9BU64 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPOQ9BU64 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPOQ9BU64 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPOQ9BU64 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPOQ9BU64 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPOQ9BU64 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPOQ9BU64 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPOQ9BU64 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPOQ9BU64 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPOQ9BU64 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPOQ9BU64 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPOQ9BU64 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPOQ9BU64 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPOQ9BU64 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPOQ9BU64 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPOQ9BU64 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPOQ9BU64 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPOQ9BU64 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPOQ9BU64 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPOQ9BU64 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPOQ9BU64 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPOQ9BU64 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPOQ9BU64 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPOQ9BU64 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPOQ9BU64 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPOQ9BU64 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPOQ9BU64 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPOQ9BU64 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPOQ9BU64 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPOQ9BU64 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPOQ9BU64 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPOQ9BU64 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPOQ9BU64 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPOQ9BU64 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPOQ9BU64 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPOQ9BU64 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPOQ9BU64 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPOQ9BU64 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPOQ9BU64 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPOQ9BU64 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPOQ9BU64 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPOQ9BU64 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPOQ9BU64 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPOQ9BU64 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPOQ9BU64 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPOQ9BU64 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPOQ9BU64 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPOQ9BU64 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CENPOQ9BU64 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CENPOQ9BU64 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPOQ9BU64 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPOQ9BU64 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPOQ9BU64 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPOQ9BU64 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPOQ9BU64 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPOQ9BU64 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPOQ9BU64 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPOQ9BU64 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPOQ9BU64 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPOQ9BU64 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPOQ9BU64 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPOQ9BU64 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPOQ9BU64 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPOQ9BU64 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPOQ9BU64 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPOQ9BU64 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPOQ9BU64 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CENPOQ9BU64 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPOQ9BU64 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPOQ9BU64 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPOQ9BU64 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPOQ9BU64 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPOQ9BU64 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPOQ9BU64 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CENPOQ9BU64 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPOQ9BU64 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CENPOQ9BU64 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CENPOQ9BU64 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CENPOQ9BU64 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CENPOQ9BU64 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CENPOQ9BU64 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CENPOQ9BU64 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CENPOQ9BU64 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPOQ9BU64 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms