Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT81

SOX7, Transcription factor SOX-7, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX7Q9BT81 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SOX7Q9BT81 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOX7Q9BT81 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOX7Q9BT81 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOX7Q9BT81 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOX7Q9BT81 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOX7Q9BT81 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOX7Q9BT81 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOX7Q9BT81 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SOX7Q9BT81 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOX7Q9BT81 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOX7Q9BT81 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SOX7Q9BT81 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOX7Q9BT81 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOX7Q9BT81 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOX7Q9BT81 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOX7Q9BT81 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOX7Q9BT81 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SOX7Q9BT81 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SOX7Q9BT81 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SOX7Q9BT81 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SOX7Q9BT81 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SOX7Q9BT81 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SOX7Q9BT81 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SOX7Q9BT81 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SOX7Q9BT81 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SOX7Q9BT81 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SOX7Q9BT81 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SOX7Q9BT81 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SOX7Q9BT81 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOX7Q9BT81 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOX7Q9BT81 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOX7Q9BT81 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOX7Q9BT81 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOX7Q9BT81 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOX7Q9BT81 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOX7Q9BT81 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOX7Q9BT81 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SOX7Q9BT81 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SOX7Q9BT81 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SOX7Q9BT81 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SOX7Q9BT81 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SOX7Q9BT81 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOX7Q9BT81 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOX7Q9BT81 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOX7Q9BT81 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOX7Q9BT81 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOX7Q9BT81 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SOX7Q9BT81 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOX7Q9BT81 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SOX7Q9BT81 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SOX7Q9BT81 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SOX7Q9BT81 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SOX7Q9BT81 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SOX7Q9BT81 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOX7Q9BT81 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOX7Q9BT81 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOX7Q9BT81 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOX7Q9BT81 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOX7Q9BT81 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOX7Q9BT81 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOX7Q9BT81 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOX7Q9BT81 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOX7Q9BT81 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOX7Q9BT81 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOX7Q9BT81 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOX7Q9BT81 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOX7Q9BT81 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOX7Q9BT81 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOX7Q9BT81 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOX7Q9BT81 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOX7Q9BT81 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOX7Q9BT81 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOX7Q9BT81 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOX7Q9BT81 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SOX7Q9BT81 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SOX7Q9BT81 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SOX7Q9BT81 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SOX7Q9BT81 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SOX7Q9BT81 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SOX7Q9BT81 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOX7Q9BT81 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOX7Q9BT81 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOX7Q9BT81 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOX7Q9BT81 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOX7Q9BT81 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SOX7Q9BT81 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SOX7Q9BT81 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SOX7Q9BT81 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOX7Q9BT81 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOX7Q9BT81 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOX7Q9BT81 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOX7Q9BT81 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOX7Q9BT81 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOX7Q9BT81 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOX7Q9BT81 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOX7Q9BT81 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SOX7Q9BT81 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SOX7Q9BT81 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOX7Q9BT81 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.6 ms