Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT76

UPK3B, Uroplakin-3b, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BQ9BT76 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UPK3BQ9BT76 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UPK3BQ9BT76 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
UPK3BQ9BT76 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
UPK3BQ9BT76 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UPK3BQ9BT76 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UPK3BQ9BT76 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UPK3BQ9BT76 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
UPK3BQ9BT76 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UPK3BQ9BT76 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UPK3BQ9BT76 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UPK3BQ9BT76 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UPK3BQ9BT76 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UPK3BQ9BT76 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UPK3BQ9BT76 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UPK3BQ9BT76 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UPK3BQ9BT76 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UPK3BQ9BT76 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UPK3BQ9BT76 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UPK3BQ9BT76 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UPK3BQ9BT76 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UPK3BQ9BT76 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UPK3BQ9BT76 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UPK3BQ9BT76 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UPK3BQ9BT76 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UPK3BQ9BT76 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UPK3BQ9BT76 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UPK3BQ9BT76 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UPK3BQ9BT76 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UPK3BQ9BT76 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UPK3BQ9BT76 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UPK3BQ9BT76 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UPK3BQ9BT76 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UPK3BQ9BT76 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UPK3BQ9BT76 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UPK3BQ9BT76 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UPK3BQ9BT76 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UPK3BQ9BT76 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
UPK3BQ9BT76 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UPK3BQ9BT76 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
UPK3BQ9BT76 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UPK3BQ9BT76 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UPK3BQ9BT76 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UPK3BQ9BT76 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UPK3BQ9BT76 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UPK3BQ9BT76 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UPK3BQ9BT76 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UPK3BQ9BT76 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UPK3BQ9BT76 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UPK3BQ9BT76 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UPK3BQ9BT76 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UPK3BQ9BT76 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UPK3BQ9BT76 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UPK3BQ9BT76 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UPK3BQ9BT76 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UPK3BQ9BT76 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UPK3BQ9BT76 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UPK3BQ9BT76 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UPK3BQ9BT76 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UPK3BQ9BT76 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
UPK3BQ9BT76 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
UPK3BQ9BT76 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
UPK3BQ9BT76 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
UPK3BQ9BT76 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UPK3BQ9BT76 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UPK3BQ9BT76 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
UPK3BQ9BT76 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
UPK3BQ9BT76 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
UPK3BQ9BT76 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
UPK3BQ9BT76 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
UPK3BQ9BT76 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
UPK3BQ9BT76 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
UPK3BQ9BT76 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
UPK3BQ9BT76 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
UPK3BQ9BT76 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
UPK3BQ9BT76 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
UPK3BQ9BT76 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
UPK3BQ9BT76 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
UPK3BQ9BT76 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
UPK3BQ9BT76 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
UPK3BQ9BT76 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
UPK3BQ9BT76 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
UPK3BQ9BT76 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UPK3BQ9BT76 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UPK3BQ9BT76 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
UPK3BQ9BT76 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
UPK3BQ9BT76 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
UPK3BQ9BT76 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UPK3BQ9BT76 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UPK3BQ9BT76 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UPK3BQ9BT76 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UPK3BQ9BT76 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UPK3BQ9BT76 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UPK3BQ9BT76 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
UPK3BQ9BT76 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UPK3BQ9BT76 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UPK3BQ9BT76 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UPK3BQ9BT76 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UPK3BQ9BT76 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UPK3BQ9BT76 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms