Protein–RNA interactions for Protein: Q99959

PKP2, Plakophilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP2Q99959 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PKP2Q99959 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PKP2Q99959 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PKP2Q99959 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PKP2Q99959 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PKP2Q99959 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PKP2Q99959 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PKP2Q99959 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PKP2Q99959 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PKP2Q99959 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PKP2Q99959 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PKP2Q99959 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PKP2Q99959 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PKP2Q99959 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PKP2Q99959 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PKP2Q99959 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PKP2Q99959 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PKP2Q99959 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PKP2Q99959 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PKP2Q99959 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PKP2Q99959 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PKP2Q99959 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PKP2Q99959 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PKP2Q99959 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PKP2Q99959 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PKP2Q99959 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PKP2Q99959 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PKP2Q99959 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PKP2Q99959 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PKP2Q99959 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PKP2Q99959 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PKP2Q99959 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PKP2Q99959 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PKP2Q99959 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PKP2Q99959 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PKP2Q99959 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PKP2Q99959 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PKP2Q99959 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PKP2Q99959 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PKP2Q99959 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PKP2Q99959 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PKP2Q99959 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PKP2Q99959 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PKP2Q99959 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PKP2Q99959 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PKP2Q99959 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PKP2Q99959 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PKP2Q99959 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PKP2Q99959 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PKP2Q99959 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PKP2Q99959 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PKP2Q99959 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PKP2Q99959 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PKP2Q99959 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PKP2Q99959 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PKP2Q99959 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PKP2Q99959 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PKP2Q99959 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PKP2Q99959 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PKP2Q99959 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PKP2Q99959 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PKP2Q99959 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PKP2Q99959 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PKP2Q99959 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PKP2Q99959 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PKP2Q99959 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PKP2Q99959 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PKP2Q99959 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PKP2Q99959 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PKP2Q99959 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PKP2Q99959 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PKP2Q99959 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PKP2Q99959 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PKP2Q99959 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PKP2Q99959 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PKP2Q99959 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PKP2Q99959 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PKP2Q99959 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PKP2Q99959 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PKP2Q99959 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PKP2Q99959 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PKP2Q99959 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PKP2Q99959 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PKP2Q99959 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PKP2Q99959 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PKP2Q99959 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PKP2Q99959 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PKP2Q99959 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PKP2Q99959 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PKP2Q99959 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PKP2Q99959 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PKP2Q99959 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PKP2Q99959 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PKP2Q99959 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PKP2Q99959 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PKP2Q99959 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PKP2Q99959 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PKP2Q99959 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PKP2Q99959 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PKP2Q99959 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms