Protein–RNA interactions for Protein: Q99941

ATF6B, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 beta, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF6BQ99941 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATF6BQ99941 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATF6BQ99941 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ATF6BQ99941 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATF6BQ99941 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATF6BQ99941 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATF6BQ99941 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ATF6BQ99941 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATF6BQ99941 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATF6BQ99941 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATF6BQ99941 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATF6BQ99941 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATF6BQ99941 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATF6BQ99941 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATF6BQ99941 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATF6BQ99941 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ATF6BQ99941 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ATF6BQ99941 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATF6BQ99941 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATF6BQ99941 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATF6BQ99941 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATF6BQ99941 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATF6BQ99941 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATF6BQ99941 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATF6BQ99941 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATF6BQ99941 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATF6BQ99941 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATF6BQ99941 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATF6BQ99941 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATF6BQ99941 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ATF6BQ99941 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATF6BQ99941 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATF6BQ99941 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATF6BQ99941 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATF6BQ99941 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATF6BQ99941 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATF6BQ99941 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATF6BQ99941 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATF6BQ99941 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATF6BQ99941 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATF6BQ99941 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATF6BQ99941 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATF6BQ99941 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATF6BQ99941 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATF6BQ99941 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATF6BQ99941 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATF6BQ99941 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATF6BQ99941 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATF6BQ99941 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATF6BQ99941 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATF6BQ99941 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATF6BQ99941 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATF6BQ99941 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATF6BQ99941 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATF6BQ99941 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATF6BQ99941 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATF6BQ99941 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATF6BQ99941 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATF6BQ99941 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATF6BQ99941 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATF6BQ99941 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATF6BQ99941 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATF6BQ99941 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATF6BQ99941 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATF6BQ99941 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATF6BQ99941 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATF6BQ99941 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATF6BQ99941 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ATF6BQ99941 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATF6BQ99941 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATF6BQ99941 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATF6BQ99941 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATF6BQ99941 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATF6BQ99941 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATF6BQ99941 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATF6BQ99941 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATF6BQ99941 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATF6BQ99941 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATF6BQ99941 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATF6BQ99941 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATF6BQ99941 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ATF6BQ99941 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATF6BQ99941 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATF6BQ99941 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATF6BQ99941 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATF6BQ99941 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATF6BQ99941 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATF6BQ99941 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATF6BQ99941 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
ATF6BQ99941 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATF6BQ99941 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATF6BQ99941 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ATF6BQ99941 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATF6BQ99941 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATF6BQ99941 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATF6BQ99941 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATF6BQ99941 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATF6BQ99941 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATF6BQ99941 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATF6BQ99941 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms