Protein–RNA interactions for Protein: Q99470

SDF2, Stromal cell-derived factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDF2Q99470 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SDF2Q99470 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SDF2Q99470 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SDF2Q99470 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SDF2Q99470 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SDF2Q99470 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SDF2Q99470 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SDF2Q99470 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SDF2Q99470 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SDF2Q99470 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SDF2Q99470 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SDF2Q99470 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SDF2Q99470 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SDF2Q99470 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SDF2Q99470 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SDF2Q99470 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SDF2Q99470 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SDF2Q99470 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SDF2Q99470 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SDF2Q99470 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SDF2Q99470 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SDF2Q99470 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SDF2Q99470 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SDF2Q99470 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SDF2Q99470 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SDF2Q99470 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SDF2Q99470 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SDF2Q99470 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SDF2Q99470 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SDF2Q99470 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SDF2Q99470 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SDF2Q99470 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SDF2Q99470 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SDF2Q99470 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SDF2Q99470 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SDF2Q99470 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SDF2Q99470 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SDF2Q99470 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SDF2Q99470 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SDF2Q99470 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SDF2Q99470 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SDF2Q99470 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SDF2Q99470 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SDF2Q99470 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SDF2Q99470 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SDF2Q99470 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SDF2Q99470 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SDF2Q99470 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SDF2Q99470 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SDF2Q99470 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SDF2Q99470 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SDF2Q99470 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SDF2Q99470 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SDF2Q99470 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SDF2Q99470 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SDF2Q99470 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SDF2Q99470 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SDF2Q99470 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SDF2Q99470 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SDF2Q99470 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SDF2Q99470 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SDF2Q99470 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SDF2Q99470 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SDF2Q99470 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SDF2Q99470 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SDF2Q99470 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SDF2Q99470 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SDF2Q99470 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SDF2Q99470 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SDF2Q99470 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SDF2Q99470 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SDF2Q99470 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SDF2Q99470 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SDF2Q99470 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SDF2Q99470 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SDF2Q99470 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SDF2Q99470 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SDF2Q99470 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SDF2Q99470 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SDF2Q99470 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SDF2Q99470 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SDF2Q99470 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SDF2Q99470 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SDF2Q99470 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SDF2Q99470 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SDF2Q99470 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SDF2Q99470 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SDF2Q99470 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SDF2Q99470 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SDF2Q99470 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SDF2Q99470 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SDF2Q99470 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SDF2Q99470 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SDF2Q99470 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SDF2Q99470 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SDF2Q99470 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SDF2Q99470 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SDF2Q99470 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SDF2Q99470 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SDF2Q99470 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms