Protein–RNA interactions for Protein: Q96T21

SECISBP2, Selenocysteine insertion sequence-binding protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 854 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SECISBP2Q96T21 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SECISBP2Q96T21 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SECISBP2Q96T21 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SECISBP2Q96T21 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SECISBP2Q96T21 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SECISBP2Q96T21 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SECISBP2Q96T21 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SECISBP2Q96T21 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SECISBP2Q96T21 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SECISBP2Q96T21 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SECISBP2Q96T21 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SECISBP2Q96T21 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SECISBP2Q96T21 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SECISBP2Q96T21 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SECISBP2Q96T21 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SECISBP2Q96T21 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SECISBP2Q96T21 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SECISBP2Q96T21 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SECISBP2Q96T21 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SECISBP2Q96T21 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SECISBP2Q96T21 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SECISBP2Q96T21 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SECISBP2Q96T21 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SECISBP2Q96T21 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SECISBP2Q96T21 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SECISBP2Q96T21 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SECISBP2Q96T21 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SECISBP2Q96T21 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SECISBP2Q96T21 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SECISBP2Q96T21 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SECISBP2Q96T21 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SECISBP2Q96T21 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SECISBP2Q96T21 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SECISBP2Q96T21 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SECISBP2Q96T21 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SECISBP2Q96T21 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SECISBP2Q96T21 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SECISBP2Q96T21 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SECISBP2Q96T21 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SECISBP2Q96T21 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SECISBP2Q96T21 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SECISBP2Q96T21 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SECISBP2Q96T21 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SECISBP2Q96T21 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SECISBP2Q96T21 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SECISBP2Q96T21 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SECISBP2Q96T21 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SECISBP2Q96T21 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SECISBP2Q96T21 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SECISBP2Q96T21 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SECISBP2Q96T21 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SECISBP2Q96T21 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SECISBP2Q96T21 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SECISBP2Q96T21 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SECISBP2Q96T21 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SECISBP2Q96T21 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SECISBP2Q96T21 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SECISBP2Q96T21 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SECISBP2Q96T21 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SECISBP2Q96T21 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SECISBP2Q96T21 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SECISBP2Q96T21 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SECISBP2Q96T21 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SECISBP2Q96T21 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SECISBP2Q96T21 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SECISBP2Q96T21 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SECISBP2Q96T21 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SECISBP2Q96T21 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SECISBP2Q96T21 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SECISBP2Q96T21 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SECISBP2Q96T21 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SECISBP2Q96T21 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SECISBP2Q96T21 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SECISBP2Q96T21 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SECISBP2Q96T21 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SECISBP2Q96T21 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SECISBP2Q96T21 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SECISBP2Q96T21 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SECISBP2Q96T21 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SECISBP2Q96T21 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SECISBP2Q96T21 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SECISBP2Q96T21 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SECISBP2Q96T21 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SECISBP2Q96T21 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SECISBP2Q96T21 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SECISBP2Q96T21 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SECISBP2Q96T21 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SECISBP2Q96T21 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SECISBP2Q96T21 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SECISBP2Q96T21 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SECISBP2Q96T21 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SECISBP2Q96T21 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SECISBP2Q96T21 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SECISBP2Q96T21 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SECISBP2Q96T21 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SECISBP2Q96T21 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SECISBP2Q96T21 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SECISBP2Q96T21 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SECISBP2Q96T21 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SECISBP2Q96T21 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms