Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q40

CDK15, Cyclin-dependent kinase 15, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK15Q96Q40 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDK15Q96Q40 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CDK15Q96Q40 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDK15Q96Q40 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDK15Q96Q40 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDK15Q96Q40 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDK15Q96Q40 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDK15Q96Q40 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CDK15Q96Q40 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDK15Q96Q40 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDK15Q96Q40 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDK15Q96Q40 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDK15Q96Q40 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDK15Q96Q40 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDK15Q96Q40 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDK15Q96Q40 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDK15Q96Q40 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDK15Q96Q40 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDK15Q96Q40 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CDK15Q96Q40 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDK15Q96Q40 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDK15Q96Q40 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDK15Q96Q40 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDK15Q96Q40 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDK15Q96Q40 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDK15Q96Q40 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDK15Q96Q40 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDK15Q96Q40 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDK15Q96Q40 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDK15Q96Q40 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDK15Q96Q40 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDK15Q96Q40 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDK15Q96Q40 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDK15Q96Q40 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDK15Q96Q40 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDK15Q96Q40 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDK15Q96Q40 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDK15Q96Q40 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDK15Q96Q40 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDK15Q96Q40 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CDK15Q96Q40 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDK15Q96Q40 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDK15Q96Q40 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDK15Q96Q40 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDK15Q96Q40 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDK15Q96Q40 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDK15Q96Q40 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDK15Q96Q40 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDK15Q96Q40 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDK15Q96Q40 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDK15Q96Q40 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDK15Q96Q40 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDK15Q96Q40 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDK15Q96Q40 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDK15Q96Q40 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDK15Q96Q40 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDK15Q96Q40 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDK15Q96Q40 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDK15Q96Q40 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDK15Q96Q40 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDK15Q96Q40 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDK15Q96Q40 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK15Q96Q40 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK15Q96Q40 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK15Q96Q40 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK15Q96Q40 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK15Q96Q40 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDK15Q96Q40 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDK15Q96Q40 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDK15Q96Q40 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDK15Q96Q40 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDK15Q96Q40 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDK15Q96Q40 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDK15Q96Q40 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDK15Q96Q40 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK15Q96Q40 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK15Q96Q40 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK15Q96Q40 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK15Q96Q40 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDK15Q96Q40 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDK15Q96Q40 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDK15Q96Q40 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDK15Q96Q40 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK15Q96Q40 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK15Q96Q40 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK15Q96Q40 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDK15Q96Q40 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDK15Q96Q40 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDK15Q96Q40 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDK15Q96Q40 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDK15Q96Q40 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDK15Q96Q40 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CDK15Q96Q40 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CDK15Q96Q40 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CDK15Q96Q40 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
CDK15Q96Q40 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDK15Q96Q40 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDK15Q96Q40 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CDK15Q96Q40 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDK15Q96Q40 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms