Protein–RNA interactions for Protein: Q96MN9

ZNF488, Zinc finger protein 488, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF488Q96MN9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF488Q96MN9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF488Q96MN9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF488Q96MN9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF488Q96MN9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF488Q96MN9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF488Q96MN9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF488Q96MN9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF488Q96MN9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF488Q96MN9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF488Q96MN9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF488Q96MN9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF488Q96MN9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF488Q96MN9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF488Q96MN9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF488Q96MN9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF488Q96MN9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF488Q96MN9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF488Q96MN9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF488Q96MN9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF488Q96MN9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF488Q96MN9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF488Q96MN9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF488Q96MN9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF488Q96MN9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF488Q96MN9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF488Q96MN9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF488Q96MN9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF488Q96MN9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF488Q96MN9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF488Q96MN9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF488Q96MN9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF488Q96MN9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF488Q96MN9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF488Q96MN9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF488Q96MN9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF488Q96MN9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF488Q96MN9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF488Q96MN9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF488Q96MN9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF488Q96MN9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF488Q96MN9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF488Q96MN9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF488Q96MN9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF488Q96MN9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF488Q96MN9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF488Q96MN9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF488Q96MN9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF488Q96MN9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF488Q96MN9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF488Q96MN9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF488Q96MN9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF488Q96MN9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF488Q96MN9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF488Q96MN9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF488Q96MN9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF488Q96MN9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF488Q96MN9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF488Q96MN9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF488Q96MN9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF488Q96MN9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF488Q96MN9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF488Q96MN9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF488Q96MN9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF488Q96MN9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF488Q96MN9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF488Q96MN9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF488Q96MN9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF488Q96MN9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF488Q96MN9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF488Q96MN9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF488Q96MN9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF488Q96MN9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF488Q96MN9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF488Q96MN9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF488Q96MN9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF488Q96MN9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF488Q96MN9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF488Q96MN9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF488Q96MN9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF488Q96MN9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF488Q96MN9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF488Q96MN9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF488Q96MN9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF488Q96MN9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF488Q96MN9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF488Q96MN9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF488Q96MN9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF488Q96MN9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF488Q96MN9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF488Q96MN9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF488Q96MN9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF488Q96MN9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF488Q96MN9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF488Q96MN9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF488Q96MN9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF488Q96MN9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF488Q96MN9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF488Q96MN9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF488Q96MN9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms